Syntéza azaftalocyaninových zhášečů fluorescence vhodných pro vazbu doprostřed oligonukleotidového řetězce

Abstract

Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Matěj Machan Školitelka: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Název práce: Syntéza azaftalocyaninových zhášečů fluorescence vhodných pro vazbu doprostřed oligonukleotidového řetězce Azaftalocyaniny (AzaPc) jsou analoga ftalocyaninů s obměnou benzenových jader za jádra pyrazinová. Díky svému širokému spektru chemických a fotofyzikálních vlastností mají mnoho využití. Například mohou být využity jako fotosensitizéry ve fotodynamické terapii nebo jako fluorescenční senzory. AzaPc, které jsou substituované alkylamino skupinami, mohou být využity jako zhášeče fluorescence, a to v uspořádání jako jednoduše značené sondy (tzv. FRET sondy) nebo ve dvojitě značených sondách. AzaPc pro tuto aplikaci mají obvykle tři čtvrtiny molekuly stejné (nesoucí alkylaminové substituenty zodpovědné za zhášení fluorescence) a poslední část je modifikována funkčními skupinami pro vazbu na oligonukleotidový řetězec. V rámci této diplomové práce byl připraven vhodný nesymetrický alkylamino substituovaný AzaPc s funkčními skupinami ve tvaru T, nesoucí dvě hydroxylové skupiny, které umožní vmezeření do oligonukleotidového řetězce. Prekurzory byly syntetizovány za využití nukleofilní substituce a...

Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department: Department of Pharmaceutical chemistry and Pharmaceutical analysis Candidate: Matěj Machan Supervisor: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Title of thesis: Synthesis of novel azaphthalocyanines working as dark quenchers suitable for binding to the middle of an oligonucleotide chain Azaphthalocyanines (AzaPcs) are analogues of well-known phthalocyanines with benzene rings replaced for pyrazine ones. AzaPcs can be used in many applications due to their interesting spectral and photophysical properties, e.g. as photosensitisers in photodynamic therapy or as fluorescence sensors. The alkylamino substituted AzaPcs can be used as dark quenchers of fluorescence in mono-labeled DNA hybridization probes (FRET probes) or double-labeled probes as well. The AzaPcs for this application have typically three quarters identical (bearing alkylamino groups responsible for quenching of fluorescence) and the last quarter is modified with a functional group for attaching to oligonucleotide probe. The goal of this project was to synthesize unsymetrical AzaPc with a T-shape functional group carrying two hydroxy groups that can be used for attaching to oligonucleotide probe. The synthesis consisted of preparation of appropriately substituted...