dc.contributor.advisor | Zuna, Jan | |
dc.creator | Hovorková, Lenka | |
dc.date.accessioned | 2020-07-10T11:56:28Z | |
dc.date.available | 2020-07-10T11:56:28Z | |
dc.date.issued | 2020 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/118317 | |
dc.description.abstract | BCR-ABL1 fusion gene is a hallmark of chronic myeloid leukaemia (CML), but can be found also in patients with acute lymphoblastic leukaemia (ALL). In BCR-ABL1-positive ALL, two principal approaches for treatment response and minimal residual disease (MRD) monitoring are routinely used - quantification of genomic clonal rearrangements of immunoglobulin/T-cell receptor genes (Ig/TCR) and BCR-ABL1 expression. We established methods for determination of BCR-ABL1 genomic fusion and used the intronic breakpoints to measure MRD levels also at the BCR-ABL1 DNA level. Comparison of MRD based on Ig/TCR and genomic BCR-ABL1 in 47 consecutive childhood patients showed poor correlation in about 25 % cases with significantly higher BCR-ABL1 levels. In those patients, we found the BCR-ABL1 not only in ALL-blasts, but also in other cell subtypes (T-cells, myeloid cells) negative for clonal Ig/TCR rearrangements. For the similarity with CML we assigned this new leukaemia subtype with multilineage BCR- ABL1 involvement "CML-like" leukaemia. Our ongoing study is focused on the prognostic implications of discordant MRD results. As we characterized the genomic BCR-ABL1 fusion in 428 patients (which is to our knowledge the largest cohort described so far), we also analysed the origin of the breakpoints. Our data suggest... | en_US |
dc.description.abstract | Fúzní gen BCR-ABL1 je charakteristický pro pacienty s chronickou myeloidní leukémií (CML), je však možné jej detekovat i u části pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL). U pacientů s BCR-ABL1-pozitivní ALL jsou k hodnocení odpovědi na léčbu a stanovení minimální reziduální nemoci (MRN) využívány dva přístupy - kvantifikace klonálních přestaveb imunoreceptorových genů (Ig/TCR) na DNA úrovni a stanovení exprese BCR-ABL1. Zavedli jsme metody k nalezení genomického přechodu BCR-ABL1 a intronové zlomy využili k monitorování MRN i kvantifikací BCR-ABL1 na DNA úrovni. Srovnání hladin MRN získaných kvantifikací přestaveb Ig/TCR a BCR-ABL1 na DNA úrovni u konsekutivní kohorty 47 dětských pacientů ukázalo dlouhodobě zvýšené hladiny fúzního genu přibližně u 25 % pacientů. U těchto pacientů bylo možné detekovat fúzní gen nejen v ALL blastech, ale i v buněčných typech, které nenesou klonální přestavby Ig/TCR (T-lymfocyty, myeloidní buňky). Tuto novou podskupinu leukémie s přítomností BCR-ABL1-pozitivních buněk ve více liniích jsme - na základě podobnosti s CML - označili jako "CML-like". Naše probíhající studie je zaměřena na prognostický vliv tohoto multiliniového postižení. Celkem jsme genomickou fúzi BCR-ABL1 nalezli u 428 pacientů (jedná se o dosud nejrozsáhlejší kohortu pacientů), a tak bylo možné... | cs_CZ |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, 2. lékařská fakulta | cs_CZ |
dc.title | Patogeneze dětských leukémií | cs_CZ |
dc.type | dizertační práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2020 | |
dcterms.dateAccepted | 2020-06-17 | |
dc.description.department | Department of Paediatric Haematology and Oncology | en_US |
dc.description.department | Klinika dětské hematologie a onkologie | cs_CZ |
dc.description.faculty | 2. lékařská fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Second Faculty of Medicine | en_US |
dc.identifier.repId | 154072 | |
dc.title.translated | Pathogenesis of childhood leukemia | en_US |
dc.contributor.referee | Kolenová, Alexandra | |
dc.contributor.referee | Jarošová, Marie | |
thesis.degree.name | Ph.D. | |
thesis.degree.level | doktorské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | - | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | - | en_US |
thesis.degree.program | Molecular and Cell Biology, Genetics and Virology | en_US |
thesis.degree.program | Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie | cs_CZ |
uk.thesis.type | dizertační práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | 2. lékařská fakulta::Klinika dětské hematologie a onkologie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Second Faculty of Medicine::Department of Paediatric Haematology and Oncology | en_US |
uk.faculty-name.cs | 2. lékařská fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Second Faculty of Medicine | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | 2.LF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | - | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | - | en_US |
uk.degree-program.cs | Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Molecular and Cell Biology, Genetics and Virology | en_US |
thesis.grade.cs | Prospěl/a | cs_CZ |
thesis.grade.en | Pass | en_US |
uk.abstract.cs | Fúzní gen BCR-ABL1 je charakteristický pro pacienty s chronickou myeloidní leukémií (CML), je však možné jej detekovat i u části pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL). U pacientů s BCR-ABL1-pozitivní ALL jsou k hodnocení odpovědi na léčbu a stanovení minimální reziduální nemoci (MRN) využívány dva přístupy - kvantifikace klonálních přestaveb imunoreceptorových genů (Ig/TCR) na DNA úrovni a stanovení exprese BCR-ABL1. Zavedli jsme metody k nalezení genomického přechodu BCR-ABL1 a intronové zlomy využili k monitorování MRN i kvantifikací BCR-ABL1 na DNA úrovni. Srovnání hladin MRN získaných kvantifikací přestaveb Ig/TCR a BCR-ABL1 na DNA úrovni u konsekutivní kohorty 47 dětských pacientů ukázalo dlouhodobě zvýšené hladiny fúzního genu přibližně u 25 % pacientů. U těchto pacientů bylo možné detekovat fúzní gen nejen v ALL blastech, ale i v buněčných typech, které nenesou klonální přestavby Ig/TCR (T-lymfocyty, myeloidní buňky). Tuto novou podskupinu leukémie s přítomností BCR-ABL1-pozitivních buněk ve více liniích jsme - na základě podobnosti s CML - označili jako "CML-like". Naše probíhající studie je zaměřena na prognostický vliv tohoto multiliniového postižení. Celkem jsme genomickou fúzi BCR-ABL1 nalezli u 428 pacientů (jedná se o dosud nejrozsáhlejší kohortu pacientů), a tak bylo možné... | cs_CZ |
uk.abstract.en | BCR-ABL1 fusion gene is a hallmark of chronic myeloid leukaemia (CML), but can be found also in patients with acute lymphoblastic leukaemia (ALL). In BCR-ABL1-positive ALL, two principal approaches for treatment response and minimal residual disease (MRD) monitoring are routinely used - quantification of genomic clonal rearrangements of immunoglobulin/T-cell receptor genes (Ig/TCR) and BCR-ABL1 expression. We established methods for determination of BCR-ABL1 genomic fusion and used the intronic breakpoints to measure MRD levels also at the BCR-ABL1 DNA level. Comparison of MRD based on Ig/TCR and genomic BCR-ABL1 in 47 consecutive childhood patients showed poor correlation in about 25 % cases with significantly higher BCR-ABL1 levels. In those patients, we found the BCR-ABL1 not only in ALL-blasts, but also in other cell subtypes (T-cells, myeloid cells) negative for clonal Ig/TCR rearrangements. For the similarity with CML we assigned this new leukaemia subtype with multilineage BCR- ABL1 involvement "CML-like" leukaemia. Our ongoing study is focused on the prognostic implications of discordant MRD results. As we characterized the genomic BCR-ABL1 fusion in 428 patients (which is to our knowledge the largest cohort described so far), we also analysed the origin of the breakpoints. Our data suggest... | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, 2. lékařská fakulta, Klinika dětské hematologie a onkologie | cs_CZ |
thesis.grade.code | P | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |