DNA methylation changes in oropharyngeal carcinoma

Abstract

utická fa á é Katedra biochemických věd Kandidát: Natália Birknerová Školitel: doc. Petra Matoušková, Ph.D. Název diplomové práce: Zmeny v metylácií DNA u orofaryngeáneho karcinó Orofaryngeálny karcinóm sa radí medzi karcinómy hlavy a krku, ktoré sú siedmym ajčastejším malígnym ochorením v celosvetovom meradle. Prevažná väčšina ( sú karcinómy skvamóznych buniek. Orofaryngeálny karcinóm zahŕňa nádory jazyka, mandlí, mäkkého podnebia a hltanu. tradičných rizikových v, ľudský papillomavírus bol aný ako ďalší rizikový faktor pre vývoj týchto nádorov. Epigenetické zmeny sú dedičné zmeny v génovej expresii, pri ktorých nedochádza k zmenám môžu prispievať ku karcinogenéze. Zahrňujú DNA metyláciu, modifikáciu histónov transkripčnú génovú reguláciu pomocou mi Cieľom tejto štúdie bolo preskúmať hladiny metylácie vybraných tumor supresorových génov u spinocelulárneho karcinómu orofaryngeálnych buniek (OPS v porovnaní s nenádorovým kontrolnými Hladiny metylácie DNA vybraných tumor supresorových génov boli analyzované metylačne špecifi amplifikáci sond záv slej od ligácie (MS MLPA) v nádorových vzorkách ich prislúchajúcich metastázach, nemetastázujúcich nádorových vzorkách a kontrolných vzorkách (nenádorové mandle). Pomocou 15% medznej hodnoty pre metyláciu sme pozorovali štatisticky významne vyššiu metyláciu v génoch...

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Natália Birknerová Supervisor: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. Title of diploma thesis: DNA methylation changes in oropharyngeal cancer Oropharyngeal carcinoma (OPC) is a type of head and neck cancer (HNC) that represents the seventh most common malignancy worldwide. The vast majority (more than 90%) of cases are squamous cell carcinomas (SCC). OPC develops in the tissue of the tongue, tonsils, soft palate, and pharynx. In addition to traditional risk factors, human papillomavirus (HPV) has been identified as an additional independent risk factor for the development of these tumors. Epigenetic alterations refer to heritable changes in gene expression that occur without changes in the underlying DNA sequence and can contribute to carcinogenesis. They include DNA methylation, histone modification and non-coding RNAs effecting gene expression. This study aimed to investigate methylation levels of selected tumor-suppressor genes in oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) in comparison to normal oropharyngeal tissue. DNA methylation levels of selected tumor-suppressor genes were analyzed using Methylation- Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MS-MLPA) in metastatic tumor...