Studium patogeneze infekce, kterou způsobují bakterie komplexu Burkholderia cepacia u nemocných cystickou fibrózou

Abstract

Souhrn: Bakterie komplexu Burkholderia cepacia (Bcc) a bakterie Pseudomonas aeruginosa patří mezi nejzávažnější patogeny způsobující plicní infekce u pacientů s cystickou fibrózou (CF). Tyto bakterie jsou vysoce rezistentní k téměř všem dostupným antibiotikům. Kromě problematické léčby je dalším závažným problémem riziko vzniku epidemické infekce, které je dané schopností některých kmenů šířit se mezi pacienty. Některé kmeny bakterií Bcc jsou schopny přejít do krevního řečiště a způsobit závažný septický stav zvaný cepacia syndrom. Jedním z takových kmenů je český epidemický kmen B. cenocepacia ST32, který se v 90. letech 20. století rozšířil mezi českými pacienty s CF. Cílem této práce bylo porovnat transkriptomový profil izolátů získaných z krve pacientů ve fázi cepacia syndromu s profilem izolátů získaných ze sputa pacientů ve stabilní fázi infekce, případně v exacerbaci. Na základě porovnání vybrat vhodné geny s rozdílnou expresí, které by mohly být využity jako případný marker pro detekci blížícího se cepacia syndromu. Vybraný vhodný "marker", který by měl zároveň kódovat obecně známý faktor virulence, podrobit hlubšímu studium pro porozumění jeho funkce a vlivu na virulenci v okamžiku cepacia syndromu. Posledním cílem této práce bylo zhodnocení epidemiologické situace bakterií P. aeruginosa u pacientů...

Summary: Bacteria from Burkholderia cepacia complex (Bcc) and bacteria Pseudomonas aeruginosa belong among the most serious pathogens causing lung infections in patients with cystic fibrosis (CF). These bacteria are highly resistant to almost all of the available antibiotics. Another serious problem is the ability of certain strains to spread among the patients, which can cause an epidemic infection. Some of the Bcc strains are capable of entering the bloodstream and causing serious septic condition called cepacia syndrome. One of these strains is the Czech epidemic strain B. cenocepacia ST32, which spread among Czech patients with CF in the 90s of the 20th century. The aim of this study was to compare transcriptome profiles of isolates gained from blood of patients with cepacia syndrome with transcriptome profiles of isolates gained from sputum of patients in the stable phase eventually exacerbation, and to choose the most appropriate genes with the different expression, which could be used as a possible marker for detection of arising cepacia syndrome. Another aim of this study was to do further study of function and influence on virulence of chosen marker (which is coding generally known virulence factor) in the time of cepacia syndrome. The last aim was to assess the epidemiologic situation of bacteria...