Studium poškození DNA pomocí PCR

Abstract

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department od Biochemical Sciences Candidate: Bc. Adéla Jansová Supervisor: PharmDr. Anna Jirkovská, Ph.D. Title of thesis: Using PCR to study the DNA damage Key words: functions of DNA, DNA damage, PCR, SINE elements The transmission of genetic information to future generations is possible thanks to DNA replication using enzymes, mainly DNA polymerase. The most important function of DNA is the biosynthesis of proteins that perform specific functions throughout the cell. The coding DNA sequences are the source for protein synthesis. These are produced by transcription of a DNA sequence using RNA polymerase and then translated into amino acids by translation. Non-coding sequences have mainly regulatory functions, they are functional DNA molecules (rRNA, tRNA, snRNA) and regulatory regions (promoters, enhancers and silencers) as well as transposons (SINE, LINE) and pseudogenes. DNA damage is caused by UV radiation, ionizing radiation, chemicals (cisplatin-based drugs, alkylating agents, etc.), reactive oxygen species, and DNA damage by base deamination. When damage occurs, repair processes are activated to remove mismatches, adducts and breaks. If the damage is not repaired by repair processes, the damage leads to mutation formation, senescence...

Abstakt Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Biochemických věd Kandidátka: Bc. Adéla Jansová Školitel: PharmDr. Anna Jirkovská, Ph.D. Název diplomové práce: Studium poškození DNA pomocí PCR Klíčová slova: funkce DNA, DNA poškození, PCR, SINE elementy Předávání genetické informace budoucím generacím je možné díky replikaci DNA za pomoci enzymů, hlavně DNA polymerasy. Nejdůležitější funkcí DNA je biosyntéza proteinů, které vykonávají specifické funkce v celé buňce. Kódující DNA sekvence jsou zdrojem pro syntézu proteinů. Ty vznikají transkripcí dané sekvence za pomoci RNA polymerasy a následně jsou translací přeloženy na aminokyseliny. Nekódující sekvence mají hlavně regulační funkce, jsou to funkční molekuly DNA (rRNA, tRNA, snRNA) a regulační oblasti (promotory, zesilovače a tlumiče), dále také transpozony (SINE, LINE) a pseudogeny. Poškození DNA způsobuje UV záření, ionizační záření, chemické látky (léky na bázi cisplatiny, alkylační látky, apod.), reaktivní formy kyslíku a také dochází k poškození DNA deaminací bází. Při poškození se aktivují opravné procesy, které odstraňují chybné párování, addukty a zlomy. Pokud se nepodaří poškození odstranit opravnými procesy, dochází k tvorbě mutací, senescenci nebo buněčné smrti. Stanovit poškození DNA je možné několika metodami podle...