Bioinformatické aspekty nukleárních receptorů ve farmakoterapii

Abstract

IN ENGLISH LANGUAGE Candidate: Mgr. Josef Škoda Supervisor: Prof. PharmDr. Petr Pávek, PhD. Title of the doctoral thesis: Bioinformatical aspects of nuclear receptors in pharmacotherapy The liver plays a central role in energy homeostasis via processing post-prandial excess energy into storage molecules and reusing stored energy via gluconeogenesis during the fasting period. This tight energy balance is maintained by a myriad of regulating processes. Dysfunction of metabolic control is a key event of severe diseases in today's population, starting with obesity, insulin resistance, and metabolic syndrome, proceeding to end-stage complications in type 2 diabetes, whole organ malfunctions, or even tumor diseases. Master players in metabolic regulation are nuclear receptors (NR) activated by endogenous stimuli or scavenging for nutritional or toxicological signals. NRs regulate gene transcription activation and therefore maintain liver metabolic plasticity. In this thesis, modern molecular biology approaches were used to study ligands of NRs and the effects of their treatment. After the typical activation of a NR, hundreds of genes are regulated, which is beyond the ability to study with conventional biology methods. For this purpose, omics methods are an ideal solution. They are characterized by...

V ČESKÉM JAZYCE Kandidát: Mgr. Josef Škoda Školitel: Prof. PharmDr. Petr Pávek, PhD. Název doktorské práce: Bioinformatické aspekty nukleárních receptorů ve farmakoterapii Játra zastávají centrální roli v energetické homeostáze, ukládají postprandiální přebytky energie do zásobních molekul a využívají zásobní energii pro glukoneogenezi během lačnění. Tato citlivá energetická rovnováha je udržována nesčetným množstvím regulačních procesů. Nefunkční kontrola metabolismu je klíčová podstata vzniku vážných onemocnění dnešní populace, začínající obezitou, insulinovou resistencí a metabolickým syndromem, pokračující ke komplikacím konečných stádií diabetu druhého typu, orgánového selhání nebo dokonce nádorovými onemocněními. Hlavní hráči regulace metabolismu jsou nukleární receptory (NR), které po aktivaci endogenními stimuly, nutričními nebo toxikologickými signály regulují transkripci a udržují metabolickou plasticitu jater. V této práci jsme použili moderní metody molekulární biologie pro studium ligandů nukleárních receptorů a efektů jejich aplikace. Po klasické aktivaci NR jsou regulované stovky genů, studovat tyto děje je mimo možnosti klasických biologických metod. Pro tento účel jsou ideálním řešením omics metody, které jsou charakterizované necílenou a obsáhlou analýzou velké funkční nebo...