Zobrazit minimální záznam

Analýza molekulárních drah a interraktomu FUBP3
dc.contributor.advisorJirkovský, Eduard
dc.creatorBrychta, David
dc.date.accessioned2024-05-24T06:28:15Z
dc.date.available2024-05-24T06:28:15Z
dc.date.issued2023
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/189127
dc.description.abstractCharles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology and Toxicology Candidate: David Brychta Supervisor: Assist. Prof. Eduard Jirkovský, PharmD, PhD.; Assist. Prof. Nika M. Lovšin, M.Chem., PhD Title of Diploma Thesis: Analysis of the molecular pathways and interactome of FUBP3 The far upstream element-binding protein 3 (FUBP3) has been recognized by genome-wide association studies to be associated with a higher risk of osteoporotic fracture. The knowledge about this protein and its role in bone biology is quite limited, though. Therefore, we aimed to broaden the horizons and created an overview of FUBP3 protein-protein interactors and possible pathway involvement. The interacting proteins were gathered across multiple databases. Their association with osteoporosis (OP) and bone mineral density (BMD) was assessed using an online tool - OpenTargets Platform. Twelve hits associated with either were then used for qPCR analysis to investigate the influence of FUBP3 knockout. Among FUBP3 interactors were also proteins of cytosolic membraneless organelles - stress granules (SG). Stress conditions were induced and co-localization of SG markers PABPC1 and G3BP1 was carried out using immunostaining and fluorescence microscopy. We were able to identify 75 protein interactors...en_US
dc.description.abstractUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Kandidát: David Brychta Školitel: PharmDr. Eduard Jirkovský, PhD.; Nika M. Lovšin, M. Chem., PhD Název diplomové práce: Analýza molekulárních drah a interaktomu FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 (FUBP3) byl pangenomickými asociačními studiemi spojován s vyšším rizikem osteoporotických fraktur. Znalosti o tomto proteinu a jeho roli v biologii kostí jsou však značně omezené. Proto jsme si vytyčili za cíl rozšířit obzory a vytvořit přehled proteinů interagujících s FUBP3 a zmapovat možné zapojení do buněčných drah. Interagující proteiny byly shromážděny z různých databázích. Jejich asociace s osteoporózou (OP) a kostní minerální hustotou (BMD) byla hodnocena pomocí online nástroje - OpenTargets Platform. Několik z nich pak bylo použito pro qPCR analýzu k posouzení vlivu knockoutu FUBP3. Mezi interaktory FUBP3 se objevovaly i proteiny cytosolických bezmembránových organel - stresových granulí (SG). Vytvořili jsme stresové podmínky a byla provedena co-lokalizace SG markerů PABPC1 a G3BP1 pomocí imunobarvení a fluorescenční mikroskopie. Podařilo se nám identifikovat 75 proteinů interagujících s FUBP3 spojených buď s OP nebo BMD, z nichž 8 bylo vybráno pro qPCR analýzu. Zjistili jsme, že osteocalcin,...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.subjectFUBP3en_US
dc.subjectinteractomeen_US
dc.subjectmolecular pathwaysen_US
dc.subjectFUBP3cs_CZ
dc.subjectinteraktomcs_CZ
dc.subjectmolekulární dráhycs_CZ
dc.titleAnalysis of the molecular pathways and interactome of FUBP3en_US
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2023
dcterms.dateAccepted2023-12-05
dc.description.departmentDepartment of Pharmacology and Toxicologyen_US
dc.description.departmentKatedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.identifier.repId262688
dc.title.translatedAnalýza molekulárních drah a interraktomu FUBP3cs_CZ
dc.contributor.refereeKarahoda, Rona
thesis.degree.namePharmDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineFarmaciecs_CZ
thesis.degree.disciplinePharmacyen_US
thesis.degree.programPharmacyen_US
thesis.degree.programFarmaciecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Pharmacology and Toxicologyen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-discipline.enPharmacyen_US
uk.degree-program.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-program.enPharmacyen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Kandidát: David Brychta Školitel: PharmDr. Eduard Jirkovský, PhD.; Nika M. Lovšin, M. Chem., PhD Název diplomové práce: Analýza molekulárních drah a interaktomu FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 (FUBP3) byl pangenomickými asociačními studiemi spojován s vyšším rizikem osteoporotických fraktur. Znalosti o tomto proteinu a jeho roli v biologii kostí jsou však značně omezené. Proto jsme si vytyčili za cíl rozšířit obzory a vytvořit přehled proteinů interagujících s FUBP3 a zmapovat možné zapojení do buněčných drah. Interagující proteiny byly shromážděny z různých databázích. Jejich asociace s osteoporózou (OP) a kostní minerální hustotou (BMD) byla hodnocena pomocí online nástroje - OpenTargets Platform. Několik z nich pak bylo použito pro qPCR analýzu k posouzení vlivu knockoutu FUBP3. Mezi interaktory FUBP3 se objevovaly i proteiny cytosolických bezmembránových organel - stresových granulí (SG). Vytvořili jsme stresové podmínky a byla provedena co-lokalizace SG markerů PABPC1 a G3BP1 pomocí imunobarvení a fluorescenční mikroskopie. Podařilo se nám identifikovat 75 proteinů interagujících s FUBP3 spojených buď s OP nebo BMD, z nichž 8 bylo vybráno pro qPCR analýzu. Zjistili jsme, že osteocalcin,...cs_CZ
uk.abstract.enCharles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology and Toxicology Candidate: David Brychta Supervisor: Assist. Prof. Eduard Jirkovský, PharmD, PhD.; Assist. Prof. Nika M. Lovšin, M.Chem., PhD Title of Diploma Thesis: Analysis of the molecular pathways and interactome of FUBP3 The far upstream element-binding protein 3 (FUBP3) has been recognized by genome-wide association studies to be associated with a higher risk of osteoporotic fracture. The knowledge about this protein and its role in bone biology is quite limited, though. Therefore, we aimed to broaden the horizons and created an overview of FUBP3 protein-protein interactors and possible pathway involvement. The interacting proteins were gathered across multiple databases. Their association with osteoporosis (OP) and bone mineral density (BMD) was assessed using an online tool - OpenTargets Platform. Twelve hits associated with either were then used for qPCR analysis to investigate the influence of FUBP3 knockout. Among FUBP3 interactors were also proteins of cytosolic membraneless organelles - stress granules (SG). Stress conditions were induced and co-localization of SG markers PABPC1 and G3BP1 was carried out using immunostaining and fluorescence microscopy. We were able to identify 75 protein interactors...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV