CTC in Colorectal Carcinoma

Abstract

Úvod: Přes celkově klesající incidenci představuje kolorektální karcinom (CRC) stále jednu z nejčastějších malignit s vysokou úmrtností. Zavedení fluidní biopsie do klinické praxe by zvýšilo množství informací o konkrétní nádorovém onemocnění, které by lékaři mohli využít při léčbě CRC. U jiných typů malignit pozorujeme rostoucí trend ve využívání tekuté biopsie, konkrétně circulating tumor DNA (ctDNA), v různých způsobech praktického využití, ze kterého by v budoucnu mohli profitovat i pacienti s CRC. Metodologie: Byly provedeny dvě studie, ve kterých byla k identifikaci a analýze cirkulujících vzácných struktur (cirkulující nádorové buňky a jiné cirkulující nebuněčné struktury) použita platforma HDSCA (High-Definition Single Cell Assay). V prvním šetření byla použita první generace platformy HDSCA sledující tři markery (CK, CD45 a DAPI). Následně byl stanoven počet nalezených podtypů cirkulujících buněk. Byla také provedena analýza dynamiky počtu těchto buněk mezi provedenými odběry. Tyto údaje byly následně korelovány s dostupnými klinickými údaji, včetně přežití pacientů bez progrese (PFS) a celkového přežití (OS). Při druhém šetření byly použity dva protokoly třetí generace platformy HDSCA. Protokol Landscape využíval pro čtvrtý imunofluorescenční (IF) kanál vimentin a CD31, zatímco protokol...

Background: Despite the overall decreasing incidence, colorectal cancer (CRC) still represents one of the most common malignancies with a high mortality rate. Introducing liquid biopsy into real-world clinical routine would increase individualized actionable information that physicians could leverage before and during CRC treatment. In other malignancy types, we have been observing increasing trend in using liquid biopsy, specifically circulating tumor DNA (ctDNA), in various use cases, which may bring future benefits to CRC patients as well. Methods: We have conducted two investigations. In both cases, the High-Definition Single Cell Assay (HDSCA) platform was used to identify and analyze circulating rare events. In the first investigation, the first generation of the HDSCA platform analyzing three markers (CK, CD45 and DAPI) was used. Subsequently, enumeration of detected rare cell subtypes was done, together with the analysis of changing levels of cells between sample collection timepoints. This data was then correlated with available clinical data, including patient's survival - progression-free (PFS) and overall (OS). In the second investigation, two protocols of the third generation of the HDSCA platform were used. The Landscape protocol utilized vimentin and CD31 for the fourth...