Development of a Web-based Framework for Visualizing Biological Neural Network Simulations

Abstract

Moderná neuroveda sa čoraz viac spolieha na simulácie biologických neurónových sietí, aby odhalila fungovanie nášho mozgu. Mozaik je framework, ktorý ponúka platformu na vykonávanie malých a rozsiahlych neurónových simulácií. Interpretácia výsledkov takýchto simulácií však môže byť náročná. Cieľom tohto projektu je vyvinúť interaktívny webový vizualizačný nástroj na zlepšenie skúmania a analýzy údajov z Mozaiku a iných podobných nástrojov. Projekt je založený na projekte Arkheia s dôrazom na vývoj používateľsky prívetivého rozhrania, modernizáciu technologického stacku a rozšírenie možností vizualizácie. Tento projekt prispeje k pokroku v počítačovej neurovedy zlepšením dostupnosti a analytickej sily výskumu neurónových simulácií.

Modern neuroscience increasingly relies on simulations of biological neural networks to unravel the complexities of how our brains work. Mozaik is a framework offering a platform for conducting small and large-scale neural simulations. However, the interpretation of such simulation results can prove challenging. This project aims to develop an interactive web- based visualization tool to enhance the exploration and analysis of data from Mozaik and other similar tools. The project is based on the Arkheia framework, with an emphasis on developing a user-friendly interface, modernizing the technology stack, and extending visualization capabilities. This project will advance computational neuroscience by enhancing the accessibility and analytical power of neural simulation research.