Gene expression profiling after experimental perinatal asphyxia and the effect of complement-derived anaphylatoxin C3a

Abstract

Úvod: Komplement se účastní ochrany a reparace mozku po jeho poškození. Pro porozumění molekulárním mechanismům těchto procesů jsme provedli profilování genové exprese s využitím kvantitativní polymerázové řetězové reakce v reálném čase (qPCR), která je jednou z nejpřesnějších moderních strategií pro analýzu genové exprese. Projekt: Projekt byl zaměřen na profilování exprese vybraných genů potenciálně ovlivňujících ztrátu a ochranu neuronální tkáně, a to během tří týdnů po hypoxicko-ischemickém poškození mozku, modelujícím perinatální asphyxii. Nedávné experimenty ukázaly, že exprese C3a pod kontrolou GFAP promotoru (C3a/GFAP) zmenšila poškození hipokampu po ligaci levé karotidy u novorozených myší o 50% ve srovnání s kontrolními myšmi. Projekt rovněž posuzuje jak místní exprese C3a/GFAP transgenu ovlivňuje expresi vybraných genů. Exprese genů byla analyzována na vzorcích z ipsilaterální a kontralaterální části hipokampu a ipsilaterální části mozkové kůry, které byly získány v čase poranění, 6 a 24 hodin; 3, 7 a 21 dní po něm. Výsledky: Výsledky ukázaly, že se regulace genové exprese po hypoxicko-ischemické příhodě liší v čase a intenzitě a může být také odlišná v příslušných oblastech mozku. Zkoumané geny lze zařadit do rodin se vztahem k uvolnění a deaktivaci neurotransmiteru (SYN II, SYN III,...

Background: The complement system is involved in neuroprotection and brain repair after brain damage. To understand the molecular mechanisms of these processes, we performed gene expression profiling using quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), which is the most accurate modern strategy for gene expression analysis. Project: Our project was directly aimed at expression profiling of selected genes potentially involved in loss and rescue of neural tissue during three weeks after hypoxic-ischemic brain injury, an experimental model of perinatal asphyxia. Recent experiments have shown that over-expression of C3a under the control of the GFAP promoter (C3a/GFAP) reduced hippocampal injury after left common carotid artery ligation in neonatal mice by 50%, compared to wild type mice. Here, we assessed how the local expression of C3a/GFAP transgene affects gene expression profiles. Gene expression was measured on samples from hippocampus ipsilateral and contralateral to the injury and ipsilateral part of cortex, taken at the time of injury, 6 and 24 hours; 3, 7 and 21 days after the injury. Results: Our data showed that the regulation of gene expression after hypoxic-ischemic injury differs in timing and intensity and may also be region dependent. The analysed genes belong to families...