The Study of Expression and Function of Selected Nuclear Receptors in Caenorhabditis Elegans

Abstract

5 Abstrakt: V genomu Caenorhabditis elegans je více než 280 jaderných hormonálních receptor (NHRs) v porovnání se 48 jadernými receptory u člov ka a 18 jadernými receptory u octomilky (Drosophila). V tšina jaderných hormonálních receptor u C. elegans pat í do skupiny suplementárních (podp rných) jaderných receptor (supnrs), které vznikly následnou duplikací jednoho p vodního genu. Evoluční tlak, který vedl ke zmnožení jaderných hormonálních receptor u nematod, stejn tak i funkce v tšiny supnrs nejsou známé. V této práci byla studována exprese sedmi gen organisovaných v klastru na chromosomu V: nhr- 206, nhr-208, nhr-207, nhr-209, nhr-154, nhr-153 a nhr-136. Metodou reverzní transkripce-kvantitativní PCR a použitím transgenních linií nesoucích f zní geny (obsahující pravd podobné promotory) s GFP bylo zjišt no, že všech sedm gen tohoto klastru je exprimováno a p t z t chto gen má částečn se p ekrývající expresní profil. Exprese byla lokalizována v jícnu, ve st ev , v určitých neuronech, v análním sv rači a v samčích specifických bu kách. ýty i geny v tomto klastru jsou zachovány u C. elegans a u C. briggsae, zatímco t i geny jsou p ítomné pouze u C. elegans, což ukazuje na pom rn nedávnou genovou expanzi. V naší práci jsme zjistili, že jak část zachovaných tak všechny nezachované geny v tomto klastru...

6 Abstract: The genome of Caenorhabditis elegans encodes more than 280 nuclear hormone receptors (NHRs) in contrast to the 48 NHRs in humans and 18 NHRs in Drosophila. The majority of the C. elegans NHRs are categorized as supplementary nuclear receptors (supnrs) that evolved by successive duplications of a single ancestral gene. The evolutionary pressures that lead to the expansion of NHRs in nematodes, as well as the function of the majority of supnrs, are not known. Here, we have studied the expression of seven genes organized in a cluster on chromosome V: nhr-206, nhr-208, nhr-207, nhr-209, nhr-154, nhr-153 and nhr- 136. Reverse transcription-quantitative PCR and analyses using transgenic lines carrying GFP fusion genes with their putative promoters revealed that all seven genes of this cluster are expressed and five have partially overlapping expression patterns including in the pharynx, intestine, certain neurons, the anal sphincter muscle, and male specific cells. Four genes in this cluster are conserved between C. elegans and C. briggsae whereas three genes are present only in C. elegans, the apparent result of a relatively recent expansion. Interestingly, we find that a subset of the conserved and non-conserved genes in this cluster respond transcriptionally to fasting in tissue-specific patterns....