Genetic factors in lymphoproliferative malignancies Focus on CHEK2 gene in lymphomas with comparison to distinct solid tumors

Abstract

Genetic factors in lymphoproliferative malignancies. Focus on CHEK2 gene in lymphomas with comparison to distinct solid tumors. MUDr. Ondřej Havránek Abstrakt dizertační práce: Úvod: Gen CHEK2 (checkpoint kinase 2) se významně podílí na regulaci signální kaskády oprav dvouřetězcových zlomů DNA a kromě jiných interaguje i s proteinem p53. U nosičů mutací genu CHEK2 bylo prokázáno zvýšené riziko vzniku řady maligních nádorů, ale jeho vztah k riziku vzniku non-Hodgkinských (NHL) a Hodgkinských (HL) lymfomů není znám. Nejčastějším polymorfismem genu TP53 R72P se u NHL zabývalo několik studií, u HL nebyl zatím zkoumán. Metody: Mutační analýza celé kódující sekvence genu CHEK2 byla provedena u 340 pacientů s NHL a analýza oblasti kódující FHA (forkhead-assodiated) doménu proteinu CHEK2 u 298 pacientů s HL. Výsledky byly porovnány s našimi analýzami CHEK2 u karcinomů prsu, kolorekta a pankreatu. U pacientů s lymfomy byl také určen genotyp polymorfizmu R72P genu TP53. Analýza byla provedena pomocí denaturační vysoce účinné kapalinové chromatografie. Výsledky: Četnost mutací v oblasti kódující FHA doménu genu CHEK2 (exon 2 a 3) byla signifikantně vyšší u pacientů s NHL i HL (19 z 340 - 5,6% a 17 z 298 - 5,7%) než u kontrolní nenádorové populace (19 z 683 - 2,8%; p = 0,03 a 0,04). Alterace v uvedené oblasti zvyšovaly...

Genetic factors in lymphoproliferative malignancies. Focus on CHEK2 gene in lymphomas with comparison to distinct solid tumors. MUDr. Ondřej Havránek Summary of PhD thesis: Background: The checkpoint kinase 2 gene (CHEK2) codes for an important mediator of DNA damage response pathway that among others interacts with the p53 protein. Mutations in the CHEK2 gene increase the risk of several cancer types, however, their role in non- Hodgkin lymphoma (NHL) and Hodgkin lymphoma (HL) is not clear. The most frequent TP53 gene R72P polymorphism was analyzed in several studies in NHL but not in HL. Methods: We have performed mutation analysis of the whole CHEK2 gene coding sequence in 340 NHL patients and the segment coding for CHEK2 forkhead-associated (FHA) domain in 298 HL patients and compared the results with our analyses of CHEK2 in breast, colorectal and pancreatic cancers. The TP53 R75P genotype was assessed in the same lymphoma populations. Both genes were analyzed using denaturing high-performance liquid chromatography. Results: The overall frequency of CHEK2 alterations within FHA-coding region was significantly higher in NHL and HL patients (19/340 - 5.6%; 17/298 - 5.7%, respectively) compared to non-cancer controls (19/683 - 2.8%; p = 0.03 and 0.04, respectively). These alterations were associated with...