Purifikace biokonjugátů azaftalocyaninů pomocí SPE

Abstract

Diplomová práce Purifikace biokonjugátů azaftalocyaninů pomocí SPE Jakub Cichý Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra Farmaceutické chemie a kontroly léčiv Tato práce se zabývá vývojem metody pro čištění biokonjugátů azaftalocyaninů pomocí extrakce tuhou fází (SPE). Tyto deriváty azaftalocyaninů jsou zkoumány jako molekulární sondy zhášející fluorescenci v různých genetických analýzách. Postupně byly uskutečněny experimenty s cílem najít ideální SPE podmínky pro tento analyt. Zkoušeli jsme různé druhy SPE kolonek a jejich vliv na extrakci. Následně byly optimalizovány jednotlivé kroky extrakce, provedeny změny pH, molarity a síly elučních roztoků se snahou získat co nejlepší separační výsledky. Jako nejlepší se jevila kolona DSC-Ph (500 mg/3 ml) a nejoptimálnější podmínky byly:  Kondicionace: 3 ml 100% MeOH + 5 ml 50mM TEAA  Nanesení vzorku: 100 μl 100nM  Promývací roztok: 9 ml 55% MeOH/50mM TEAA  Eluční roztok: 3 ml 80% MeOH/50mM TEAA Touto metodou jsme získali výtěžnost extrakce analytu okolo 70-75 %, s relativním 10% znečištěním zbytky oligonukleotidových řetězců ve finálním eluátu. Tato SPE metoda je určitou alternativou k již vyvinuté HPLC metodě pro čištění biokonjugátů azafthalocyaninů. Klíčová slova: Biokonjugáty azafthalocyaninů, SPE, příprava...

Diploma thesis The purification of bioconjugates of azaphthalocyanines by SPE Jakub Cichý Charles Univerzity in Prague, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové, Department of Pharmaceutical chemistry and drug analysis This thesis occupy the development of a method for purification biocunjugate azaphthalocyanines by solid-phase extraction (SPE). These derivates of azaphthalocyanine are investigated as molecular probes to guench of fluorescence in various genetic analysis. Experiments were carried out successuvely in order to find the ideal SPE conditions for the analyte. We tried also different type of SPE columns and their influence on the extraction. Subsequently were optimized each extraction steps, the changes in pH, molarity and strength elution solutions were made with an effort to get the best separation results. Column appeared as the best DSC-Ph (500 mg/3 ml) and the most optimal conditions were:  Condition: 3 ml 100% MeOH + 5 ml 50mM TEAA  Apply sample: 100 μl 100nM  Washing solution: 9 ml 55% MeOH/50mM TEAA  Elution solution: 3 ml 80% MeOH/50mM TEAA We obtained by this method recovery of extraction analyte around 70-75 %, with 10% relative contamination of remains oligonucleotide chains in the final eluate solution. The SPE method is an alternative to the already developed HPLC method...