Heterologní exprese a purifikace potkaní formy cytochromu P450 1A1
Heterologous expression and purification of rat cytochrome P450 1A1
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/52517Identifikátory
SIS: 116138
Kolekce
- Kvalifikační práce [20105]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Ingr, Marek
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Biochemie
Katedra / ústav / klinika
Katedra biochemie
Datum obhajoby
11. 6. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
rekombinantní potkaní CYP1A1, heterologní exprese, izolace, EROD aktivitaKlíčová slova (anglicky)
recombinant rat CYP1A1, heterologous expression, isolation, EROD activityCytochrom P450 1A1 patří do "superrodiny" cytochromů P450 (CYP). Je to extrahepatální enzym, který se podílí na detoxikačním metabolismu mnoha xenobiotik, ale bohužel také zároveň patří mezi nejvýznamnější zástupce CYP účastnící se aktivace prokarcinogenů. Hlavním cílem této práce bylo pomocí heterologní exprese připravit a izolovat potkaní cytochrom P450 1A1 v dostatečném množství a čistotě. V rámci této práce byly připraveny dva vektory nesoucí gen pro potkaní cytochrom P450 1A1 vložené do účinného expresního plasmidu pCW. Funkčnost připravených vektorů byla ověřena expresí CYP1A1 a měřením CO diferenčních spekter. Zjistilo se, že pouze jeden z vektorů poskytoval nativní protein. Tento vektor byl transformován do buněk bakterií E.coli kmene DH5α, DH5α s vneseným plasmidem pHg1 a DH5α s vneseným plasmidem pGRO7. Byly testovány různé podmínky produkce CYP1A1: růstová média (LB a TB médium), čas produkce (24 a 48h), koncentrace IPTG (0,5mM a 1mM) a přítomnost ALA. Nejvyšší exprese bylo dosaženo v buňkách E.coli DH5α kultivovaných v modifikovaném TB médiu po 48 hodinách exprese a při teplotě 30řC (indukce při 0,6 - 0,8 OD600 0,5mM IPTG s přídavkem 0,5mM ALA). Úspěšně se podařilo exprimovat také CYP1A1 bez ALA za pomocí plasmidu pHg1, což velmi sníží ekonomické náklady celé produkce. Membrány buněk...
Cytochrome P450 1A1 belongs to "superfamily" of cytochromes P450 (CYPs). It is an extrahepatic enzyme that takes a part in detoxification metabolism of many xenobiotics but unfortunately also it is one of the most important representatives of CYPs involved in the activation of procarcinogens. The main aim of this bachelor thesis was to prepare and purify cytochrome P450 1A1 in sufficient quantity and purity by heterologous expression. Two different vectors, which were constructed by inserting the gene for rat cytochrome P450 1A1 in efficient expression plasmid pCW, were prepared during this bachelor thesis. Functionality of prepared vectors was verified by measuring the expression of CYP1A1 and CO difference spectra. It was found that only one of the vectors mentioned above provides native protein. This vector was transformed into E. coli cells of strain DH5α, DH5α with the inserted plasmid pHg1 and DH5α with inserted plasmid pGRO7. Various conditions of CYP1A1 production were tested: growth media (LB or TB medium), the time of production (24 and 48h), the concentration of IPTG (0.5mM and 1mM) and the presence of ALA. The highest expression level was achieved in E. coli DH5α cells cultivated in a modified TB medium after 48 hours of production and at 30řC (induction at OD600 0.6 to 0.8 by 0.5mM...