Stanovení exprese mRNA enzymu DHRS3 v lidských tkáních pomocí real-time SYBR green qPCR

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Pavlína Rusnáková Školitel: RNDr. Lucie Zemanová, Ph.D. Název diplomové práce: Stanovení exprese mRNA enzymu DHRS3 v lidských tkáních pomocí SYBR green qPCR Dehydrogenasa/reduktasa nadrodiny SDR člen 3 (DHRS3, alternativně nazývána SDR16C1, retSDR1) je NADPH dependentní reduktasa karbonylových sloučenin, která patří do nadrodiny dehydrogenas/reduktas s krátkým řetězcem. Poprvé byl DHRS3 popsán Haeseleerem a kol. jako enzym vyskytující se ve vnějším segmentu čípků hovězí sítnice, který redukuje all-trans-retinal na all-trans-retinol v cyklu vidění. Nicméně exprese DHRS3 byla zjištěna také v jiných tkáních. Bylo prokázáno, že DHRS3 pravděpodobně hraje důležitou roli v embryogenezi a v rozvoji některých nádorů. Potvrzena byla účast DHRS3 na in vitro redukci několika endogenních látek (androstendion, DL-glyceraldehyd, estron) a xenobiotik (acetohexamid, 4-nitroacetofenon, benzil). Přestože se DHRS3 zdá být významným enzymem, který se účastní důležitých metabolických pochodů, některé jeho vlastnosti, včetně exprese v lidských tkáních, nejsou zcela dobře popsány, případně jsou dost roztříštěné. Cílem práce bylo stanovit expresi mRNA enzymu DHRS3 v lidských tkáních a přispět tak k rozvoji nových poznatků...

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Pavlína Rusnáková Supervisor: RNDr. Lucie Zemanová, PhD. Title of diploma thesis: Determination of mRNA of DHRS3 enzyme in human tissues by real-time SYBR green qPCR Dehydrogenase/reductase (SDR family) member 3 (DHRS3, also known as SDR16C1, retSDR1) is NADPH dependent carbonyl reductase, member of the short-chain dehydrogenases/reductases superfamily. DHRS3 was characterized for the first time by Haeseleer et al. as an enzyme that reduces all-trans-retinal to all-trans-retinol in the visual cycle that is localised in the outer segment of the cone photoreceptors in bovine retina. However, expression of DHRS3 was shown in some other tissues. It was proven that DHRS3 plays an important role in embryogenesis and tumour development. It was also established that DHRS3 participates in the reduction of some endogenous compounds (androstendione, estrone, DL-glyceraldehyde) and xenobiotics (acetohexamide, 4-nitroacetophenone, benzil) in vitro. DHRS3 seems to be an important enzyme with participation in significant metabolic pathways. Nevertheless, knowledge of some DHRS3 properties, including expression in human tissues, is quite poor. The aim of this study was to determine expression of DHRS3...