Identification of DNA sequence binding C/EBP and C/EBPb proteins involved in RANKL expression

Abstract

Karlova Univerzita v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Autor: Lukáš Dušek Supervisor: Ing. Lucie Křivčíková, Asist. Vid Mlakar, B. Sc. microbial., Ph.D. Název práce: Identifikace DNA sekvence vázané C/EBP a C/EBPb proteiny zapojené v expresi RANKL Osteoporóza, nebo také řídnutí kostí, je celosvětovým problémem v lidském zdraví, které neustále nabývá na významu. Johnell a Kanis ve své studii odhadli, že v roce 2000 došlo k více jak 9 miliónům osteoporotických zlomenin, což ve výsledku znamená 3 zlomeniny způsobené osteoporózou každou vteřinu [1]. Vzhledem k provázanosti kostní hustoty (BMD) s věkem a stárnutí světové populace je možné očekávat nárůst významu tématu kostního zdraví a osteoporózy zvláště. Objev osy osteoprotegerin (OPG) / receptor activator of nuclear factor kappa-B (RANK) / RANK-ligand (RANKL) v pozdních 90. letech vložil vědcům do rukou významný cíl budoucího zkoumání kostního metabolismu a odhalil zajímavá propojení s kardiovaskulárními chorobami, imunitním systémem, přežívání rakovinových buněk a kostnímu cílení metastáz. Tato práce v sobě nesla jeden experimentální a dva teoretické cíle. Experimentálním a také primárním cílem bylo identifikovat transkripční faktory a vazebná místa v oblasti -662 až -438 od promotorové oblasti genu...

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biological and Medical Sciences Author: Lukáš Dušek Supervisor: Ing. Lucie Křivčíková, Asist. Vid Mlakar, B. Sc. microbial., Ph.D. Thesis title: Identification of DNA sequence binding C/EBP and C/EBPb proteins involved in RANKL expression Bone thinning - osteoporosis - is an increasing problem of human health worldwide. Johnell and Kanis estimated that in 2000 more than 9.0 million of osteoporotic fractures occurred - this means about 3 fractures from osteoporosis every second [1]. Because the decrease in bone mineral density (BMD) is associated with age and with the aging of the world population, the issue of bone health and especially osteoporosis is expected to emerge in its urgency. Discovery of osteoprotegerin (OPG) / receptor activator of nuclear factor kappa-B (RANK) / RANK-ligand (RANKL) pathway in late 90' gave scientists a fruitful target for future investigations about bone metabolism and revealed interesting interconnections with cardiovascular diseases, immunity and cancer survival and targeting. This study had one experimental and two theoretical goals: The experimental and primary goal was to identify transcription factors and DNA binding sites in -662 to -438 region upstream of RANKL transcription start...