Porovnání fenotypu a genotypu erytrocytárních antigenů s použitím serologických a microarray metod

Abstract

Práce se zabývá genotypováním erytrocytových antigenů pomocí microarray technik. Porovnává výsledky genotypů z microarray metod s fenotypy získanými pomocí sérologických technik. Hlavním cílem práce je zhodnotit míru shodných výsledků (fenotyp - genotyp) a využitelnost microarray technik v imunohematologické laboratoři. Testování probíhalo v Národní referenční laboratoři pro imunohematologii Ústavu hematologie a krevní transfuze v Praze v období od ledna 2014 do prosince 2015. Pro genotypizaci byly použity metody BLOODchip Reference a ID CORE XT™ od firmy Progenika Biopharma S. A. Sérologicky byl fenotyp vyšetřen metodami sloupcové aglutinace v gelových kartách firem Grifols a BioRad. Do studie bylo zahrnuto 78 vzorků dárců diagnostických erytrocytů, 62 vzorků pacientů, kde nebylo možno sérologicky určit přítomnost některých antigenů, a 28 pacientů s diskrepantním výsledkem při stanovení RhD antigenu. Genotypizace dárcovských vzorků umožnila záchyt variantních a zeslabených antigenů, které nebylo možné detekovat sérologicky. U vzorků dárců byla zjištěna 100% shoda mezi výsledky sérologie a genotypování. U pacientských vzorků byla zjištěna větší variabilita v porovnání genotypovacích a sérologických technik. U vzorků polytransfundovaných pacientů, nebylo možné zjistit výsledek sérologickou metodou z...

The diploma thesis deals with the erythrocyte antigens genotyping using microarray techniques. It compares the results of microarray methods with the phenotypes obtained by serological techniques. The aim of the theses is to evaluate the degree of identical results (phenotype - genotype) and the applicability of microarray techniques in the immunohematology laboratory. The testing was carried out in the National Reference Laboratory, Institute of Hematology and Blood Transfusion, Prague, in the period January 2014 - December 2015. Methods BLOODchip Reference and ID CORE XT™, Progenika Biopharma S. A., were used for genotyping. Serological determination of phenotypes was performed using Grifols and BioRad gel agglutination techniques. The study encompassed 78 samples of healthy donors of diagnostic red blood cells, 62 patient samples with no possibility to determine the presence of certain antigens by serological methods, and 28 patient samples with the discrepant result of RhD determination. Genotyping of the donors' samples enabled to record variant and weak antigens not detectable by serological methods. Donor samples displayed 100% conformity of serological and genotyping results. Considerable variability in patients' samples was found in comparism of genotyping and serological techniques. The...