Metabolomic analysis of bile acids in various biological samples.

Abstract

Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Univerzita Východního Finska v Kuopiu, Škola Farmacie Katedra farmaceutické chemie Kandidát: Pavlína Hadravská Školitel: prof. RNDr. Lenka Skálová, Ph.D. Konzultant: prof. Seppo Auriola Název diplomové práce: Metabolomická analýza žlučových kyselin v různých biologických vzorcích Cílem práce bylo vyvinout vhodnou metodu pro kvalitativní a kvantitativní analýzu vybraných žlučových kyselin v myších játrech, lidské plazmě a především v lidských vlasech. Analyzováno bylo devět vybraných žlučových kyselin (kyselina cholová, deoxycholová, chenodeoxycholová, ursodeoxycholová, lithocholová, taurocholová, taurodeoxycholová, glykocholová a glykochenodeoxycholová). Identifikace a kvantifikace žlučových kyselin byly provedeny pomocí UHPLC přístroje se dvěma typy hybridních hmotnostních spektrometrů (kvadrupólovým analyzátorem spojeným s analyzátorem doby letu a s kvadrupólovým analyzátorem spojeným s orbitrapem). Snažili jsme se vyvinout metodu, která umožňuje detekci jak nekonjugovaných žlučových kyselin, tak i jejich glycinových a taurinových konjugátů v biologických vzorcích. K vývoji a optimalizaci této metody jsme využili myší játra a lidskou plazmu. Poté byla tato metoda použita k detekci žlučových kyselin v lidských...

Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences University of Eastern Finland in Kuopio, School of Pharmacy Department of Pharmaceutical Chemistry Candidate: Pavlína Hadravská Supervisor: prof. RNDr. Lenka Skálová, Ph.D. Consultant: prof. Seppo Auriola Title of Diploma thesis: Metabolomic analysis of bile acids in various biological samples This thesis aimed to establish a suitable qualitative and quantitative analysis of selected bile acids in mouse liver, human plasma and especially in human hair. Nine selected bile acids were analyzed (cholic acid, deoxycholic acid, chenodeoxycholic acid, ursodeoxycholic acid, lithocholic acid, taurocholic acid, taurodeoxycholic acid, glycocholic acid and glycochenodeoxycholic acid). An identification and a quantification of the bile acids have been performed by UHPLC with two types of hybrid mass spectrometers (Quadrupole connected to Time of Flight and Quadrupole connected to Orbitrap). We tried to develop a method that allows a detection of both unconjugated bile acids and their glycine- and taurine-conjugates in biological samples. To develop and optimize this method, mouse liver and human plasma were used. Afterwards, the method was used to detect bile acids in human hair, because the bile acids could serve as...