Expresia, lokalizácia a interaktom proteínu RefZ v priebehu sporulácie u Bacillus subtilis.
Expression, localisation, and interactome of the RefZ protein during sporulation in Bacillus subtilis.
Exprese, lokalizace a interaktom proteinu RefZ v průběhu sporulace u Bacillus subtilis.
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/181290Identifikátory
SIS: 242287
Kolekce
- Kvalifikační práce [19606]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Nešvera, Jan
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a genetika prokaryotických a eukaryotických mikroorganismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
31. 5. 2023
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Slovenština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
transkripce, promotor, sporulační faktory sigma, sporulace, Spo0A, RefZKlíčová slova (anglicky)
transkripction, promoter, sporulation sigma factors, sporulation, Spo0A, RefZBacillus subtilis je gram-pozitivní sporulující bakterie. Za nepříznivých životních podmínek zahajuje sporulační proces, jehož výsledkem jsou rezistentní spory. Hlavním regulátorem iniciace sporulace je transkripční faktor Spo0A. Charakteristickým znakem sporulace je tvorba asymetrického septa na buněčném pólu, které rozděluje buňku na větší mateřskou buňku a menší prespóru. Asymetrické septum je umístěno v 1/6 od nejbližšího pólu buňky, a proces lokalizace je komplexní. Jedním z aktérů podílejících se na této lokalizaci je protein RefZ, který reguluje protein FtsZ, tvořící Z-kruh. Z-kruh je důležitý pro formování vegetativního (uprostřed buňky) i asymetrického septa. RefZ konkrétně napomáhá relokalizaci Z-kruhu ze středu buňky k pólům v rané fázi sporulace. Kromě toho je RefZ protein vázající se na DNA, který se váže na vazebné motivy RefZ (RefZ binding motives [RBMs]) v blízkosti počátků replikace (ori) chromozomů, čímž podporuje přesné umístění ramen chromozomů během sporulace. Celý proces sporulace je regulován kaskádou prostorově specifických sporulačních faktorů σ, které rozpoznávají specifické konzervované (konsenzus) sekvence v promotorových oblastech genů, čímž umožňují RNA polymeráze interagovat s promotorem konkrétního genu a zahájit jeho transkripci. Takto faktory σ zajišťují prostorově...
Bacillus subtilis is a gram-positive sporulating bacterium. Under unfavorable conditions, it initiates the sporulation process that results in a resistant spore. The transcription factor Spo0A is a master regulator of sporulation initiation. The hallmark of sporulation is the formation of an asymmetric septum near a cell pole, which divides the cell into the larger mother cell and smaller prespore. The asymmetric septum is localized at 1/6 of the cell length relative to the nearer pole. One of the players involved in this localization is the RefZ protein, referred to as the FtsZ regulatory protein, which forms the Z-ring. The Z-ring is important for the formation of both the vegetative (mid-cell) and asymmetric septa. RefZ facilitates the relocalization of the Z-ring from midcell to the poles at an early stage of sporulation. RefZ also binds DNA (RefZ binding motifs [RBMs]) near the ori site of the chromosome, thereby promoting precise positioning of the chromosome arms during sporulation. The entire sporulation process is controlled by a cascade of compartment-specific sporulation σ factors that recognize specific consensus sequences in the promoter regions of genes, thereby allowing RNA polymerase to initiate transcription of sporulation-specific genes. These σ factors ensure spatially and...