The identification of novel MT1-MMP interaction partners
Identifikace nových interakčních partnerů proteinu MT1-MMP
diplomová práce (OBHÁJENO)

Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/196910Identifikátory
SIS: 252666
Kolekce
- Kvalifikační práce [20271]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Janoštiak, Radoslav
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Buněčná biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
27. 1. 2025
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
Invazivita nádorových buněk, metaloproteázy, MT1-MMP, interakční partneři, desmoglein-2, koimunoprecipitaceKlíčová slova (anglicky)
Cancer invasiveness, metalloproteinases, MT1-MMP, interaction partners, desmoglein-2, coimmunoprecipitationMembránová matrixová metaloproteáza typu 1 (MT1-MMP) je enzym, který se zásadně podílí na invazivitě nádorových buněk. V této práci jsme se zaměřili na zkoumání interakčních partnerů MT1-MMP, abychom rozšířili naše porozumění buněčným procesům, kterých se tento enzym aktivně účastní. Abychom mohli MT1-MMP purifikovat a následně analyzovat její interaktory hmotnostní spektrometrií, fúzovali jsme WT a mutantní varianty tohoto enzymu se Strep/FLAG značkou. Naše předběžné výsledky naznačují, že v lidských buňkách MT1-MMP zřejmě interaguje s proteinem desmoglein-2. Tuto potenciální interakci jsme se zde snažili ověřit pomocí imunoprecipitačních experimentů.
Membrane Type 1 Matrix Metalloproteinase (MT1-MMP) is an enzyme with critical role in cancer cells invasiveness. In this work we aimed to investigate interaction partners of MT1-MMP to broaden our understanding of the processes the enzyme takes an active part in. We have modified sequences of the metalloproteinase and its mutant variants with Strep/FLAG-tags insertion to allow for affinity purification and subsequent analysis of isolated potential interactors via mass spectrometry. Our preliminary data suggest that desmoglein-2 (DSG2) potentially binds MT1-MMP in human cells. Here we tried to verify the supposed interaction using coimunoprecipitation assays.