The identification of novel MT1-MMP interaction partners
Identifikace nových interakčních partnerů proteinu MT1-MMP
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/196910Identifiers
Study Information System: 252666
Collections
- Kvalifikační práce [20271]
Author
Advisor
Referee
Janoštiak, Radoslav
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cell Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
27. 1. 2025
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Very good
Keywords (Czech)
Invazivita nádorových buněk, metaloproteázy, MT1-MMP, interakční partneři, desmoglein-2, koimunoprecipitaceKeywords (English)
Cancer invasiveness, metalloproteinases, MT1-MMP, interaction partners, desmoglein-2, coimmunoprecipitationMembránová matrixová metaloproteáza typu 1 (MT1-MMP) je enzym, který se zásadně podílí na invazivitě nádorových buněk. V této práci jsme se zaměřili na zkoumání interakčních partnerů MT1-MMP, abychom rozšířili naše porozumění buněčným procesům, kterých se tento enzym aktivně účastní. Abychom mohli MT1-MMP purifikovat a následně analyzovat její interaktory hmotnostní spektrometrií, fúzovali jsme WT a mutantní varianty tohoto enzymu se Strep/FLAG značkou. Naše předběžné výsledky naznačují, že v lidských buňkách MT1-MMP zřejmě interaguje s proteinem desmoglein-2. Tuto potenciální interakci jsme se zde snažili ověřit pomocí imunoprecipitačních experimentů.
Membrane Type 1 Matrix Metalloproteinase (MT1-MMP) is an enzyme with critical role in cancer cells invasiveness. In this work we aimed to investigate interaction partners of MT1-MMP to broaden our understanding of the processes the enzyme takes an active part in. We have modified sequences of the metalloproteinase and its mutant variants with Strep/FLAG-tags insertion to allow for affinity purification and subsequent analysis of isolated potential interactors via mass spectrometry. Our preliminary data suggest that desmoglein-2 (DSG2) potentially binds MT1-MMP in human cells. Here we tried to verify the supposed interaction using coimunoprecipitation assays.