Epigenetická regulace exprese imunoaktivních genů u nádorových buněk

Abstract

Nádorové bujení má základ v chybné funkci genů, které ovlivňují dělení buněk, apoptózu nebo migraci buněk z jednoho místa v těle do jiného. Během vzniku nádoru mohou být umlčeny geny, které fungují jako brzda buněčného dělení nebo naopak aktivovány geny, které zvyšují schopnost buněk dělit se a odolávat programované buněčné smrti. Mechanismů, které ovlivňují funkci genů během vzniku nádoru, existuje několik. Významou roli hrají mutace genů a poškození chromozomů. Kromě toho mohou být geny inaktivovány epigenetickými mechanismy, které zahrnují modifikace histonů a methylace cytosinu v CpG párech lokalizovaných v kontrolních oblastech genů. Cílem této práce bylo objasnit, zda epigenetické mechanismy ovlivňují u vybraných nádorových linií expresi genů, které jsou důležité pro interakci nádorových buněk s imunitním systémem. Je známo, že u některých nádorů dochází pod selekčním tlakem imunitního systému ke změně exprese povrchových molekul, které jsou podstatné pro kontakt s buňkami imunitního systému. V teoretické části této práce jsou shrnuty informace o epigenetických mechanismech a jejich vlivu na geny zásadní pro tvorbu nádorů. Dále jsou uvedeny poznatky z odborné literatury na téma nádorová imunologie. Jako hlavní experimentální přístup bylo zvoleno použití inhibitorů, které ovlivňují methylaci DNA a...

The aim of this master thesis was to identify epigenetically silenced genes and to determine molecular effects of DNA methyltransferases inhibitor (5-aza-2'-deoxycytidine) and histon deacetylases inhibitor trichostatin A (TSA) on gene expression in cancer cell lines TC-1/A9 and RVP3. Epigenetic events play an important role in tumorigenesis and also in escape of cancer cells from immune surveillance. I analyzed global changes in gene expression profiles of two cell lines by microarray analysis with a special attention paid to immunoactive genes. The experimental model used for this purpose were murine tumor cell lines, MHC class I deficient. I identified epigenetic regulation of several genes that are involved in cancer and immune system interactions. These data demonstrate that epigenetic agents are capable to activate expression of genes that are important for antigen presentation, cell adhesion and apoptosis. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)