Klonování, exprese a purifikace lidské AKR1C2

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Veronika Tobolová Školitel: Prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D. Název diplomové práce: Klonování, exprese a purifikace lidské AKR1C2 Kódová sekvence AKR1C2 dodaná ve vektoru pOTB7 byla metodou PCR pomnožena a pomocí alkalické lýze přečištěna. Následně zligována s vektorem TOPO 2.1. Kódová sekvence vložená do vektoru TOPO 2.1 byla transformována do kompetentních buněk E. coli a namnožena. Pro kontrolu proběhlé ligace a transformace byla provedena inkubace buněčné kultury s ampicilinem a inkubace kódové sekvence s restrikčními endonukleasami. Poté byly vzorky sekvence v TOPO 2.1 odeslány na sekvenaci. V dalším kroku došlo k natrávení kódové sekvence v TOPO 2.1 a otevření zakoupeného vektoru pET-15b. Poté následovalo několik pokusů o ligaci sekvence s expresním vektorem pET-15b. Kontrola těchto kroků byla provedena pomocí transformace rekombinantní sekvence do buněk Hb 101, inkubace na živné půdě s antibiotikem a restrikce. V závěru byl vektor s kódovou sekvencí vložen do kompetentních buněk BL-21 a provedena exprese. Po rozbití buněk za použití sonikace a natrávení lysozymem jsme mohli pozorovat výsledek pomocí SDS PAGE.

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Veronika Tobolová Supervisor: Prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D. Title of diploma thesis: Cloning, expression and purification of human AKR1C2 The coding sequence of AKR1C2 inserted in vector pOTB7 was multiplied by PCR and purified by alkali hydrolysis. Then it was ligated together with TOPO 2.1 vector. Prepared sequence inserted in vector TOPO 2.1 was transformed into the competent E. coli cells and multiplied. To verify these steps we did incubation of cell culture with ampicilin and incubation of coding sequence with restriction endonucleases.The samples inserted in vector TOPO 2.1 were sent to do sequencing. The next step was the digestion of the coding sequence inserted in vector TOPO 2.1 and the opening of purchased expressed vector pET-15b. Then a several attempts to ligation were made. The control of these steps was done by transformation of vector pET-15b with coding sequence into Hb101 cells, by incubation of transformed cells with antibiotics and by restriction sequence. Finally, the vector with the coding sequence was transformed into competent BL-21 cells and the expression was done. The result of expression we could observe after sonication and digestion of the cells by...