Metabolomic analysis of urine samples using ultra performance liquid chromatography and high resolution mass spectrometry

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Andrea Mrvová Konzultanti: Prof. Seppo Auriola; Katedra farmaceutické chemie, Fakulta zdravotnických věd, Kuopio, Itä-Suomen Yliopisto RNDr. Milan Mokrý, CSc. Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova v Praze Název diplomové práce: Metabolomická analýza vzorků moči s využitím ultra vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie Metabolomika se zabývá analýzou nízkomolekulárních metabolitů uvnitř biologického systému. Tato disciplína slibuje velký pokrok nejen v diagnostice onemocnění. Jako nejvýhodnější materiál pro analýzu jsou tělní tekutiny (např. moč, krevní sérum, sliny) a běžně používanými analytickými technikami jsou NMR, GC/MS and LC/MS. Metabolomická analýza poskytuje značné množství dat a jejich vyhodnocení je problematickým úkolem. Je proto snahou vyvinout systém, který zefektivní identifikaci. Záměrem této práce je nalezení optimálních podmínek pro metabolomickou analýzu a testování spolehlivosti počítačem asistovaného postupu detekce a identifikace látek. Práce je předstupněm následné snahy o objevení biomárkrů a definování rozdílů v metabolomické analýze moči zdravého člověka,...

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmaceutical Chemistry and Drug Control Candidate: Andrea Mrvová Consultants: Prof. Seppo Auriola; Department of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of Health Sciences, Kuopio, University of Eastern Finland RNDr. Milan Mokrý, CSc. Department of Pharmaceutical Chemistry and Drug Control, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové, Charles University in Prague Title of Thesis: Metabolomic analysis of urine samples using ultra performance liquid chromatography and high resolution mass spectrometry Metabolomics is inquiring into the analysis of small-molecule metabolites within biologic system. This branch promises great progress not only as a diagnostic tool for disease. As suitable objects for the analysis are bio-fluids (e.g. urine, serum, saliva) and as common analytical techniques that are employed for the metabolomic analysis are NMR, GC/MS and LC/MS. Metabolomic analysis provides a great number of data and it is a problematic task to go through it. There is an effort to design system of effective identification. The aim of this work is to find optimal conditions for metabolomic analysis and to test reliability of computer-assisted workflow for the detection and identification of compounds. This should be as the first...