The regulation of the ERK signalling pathway by scaffold protein RACK1
Regulace signalní dráhy ERK prostřednictvím scaffold proteinu RACK1
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/45893Identifiers
Study Information System: 95086
Collections
- Kvalifikační práce [20096]
Author
Advisor
Referee
Filipp, Dominik
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cellular and Developmental Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
8. 6. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
MAPK, ERK, RACK1, RSK, adaptorový protein, scaffold protein, fokální adheze, signální specifita, buněčná migraceKeywords (English)
MAPK, ERK, RACK1, RSK, adaptor protein, scaffold protein, focal adhesion, signal specificity, cell motilitySignální dráha ERK, tvořená proteinkinázami Raf, MEK a ERK, je nedílnou součástí evolučně konzervovaných signálních drah MAPK rodiny umožňující eukaryotním buňkám zaznamenávat a vyhodnocovat širokou škálu vnějších podnětů. Dráha ERK převádí extracelulární signály v celou řadu specifických buněčných procesů jako je proliferace, diferenciace, apoptóza či migrace. Pro kontrolu takového množství buněčných odpovědí jedinou signální dráhou buňky vyvinuly regulační mechanizmy, které směřují signál k specifické buněčné odpovědi. Klíčovým mechanizmem regulace signální specificity jsou proteiny s neenzymatickou funkcí tzv. scaffold proteiny. Tyto proteiny váží jednotlivé komponenty MAPK dráhy a tím umožňují jejich funkční interakci, čímž určují sílu, načasování, specificitu a lokalizaci příslušného signálu v rámci buňky. Je známo, že scaffold protein RACK1 interaguje s řadou proteinů buněčné migrace, jako jsou integriny, FAK, Src a vlastní komponenty signální dráhy ERK. RACK1 také reguluje jednotlivé kroky buněčné migrace jako je ustanovení buněčné polarity a rozpad fokálních adhezí. Molekulární mechanismy stojící za těmito procesy však zůstávají nadále nejasné. Hlavním cílem této diplomové práce bylo prostudovat funkční úlohu proteinu RACK1 v rámci buněčné migrace, především pak určit nové efektorové...
The ERK signalling cascade comprised of protein kinases Raf, MEK and ERK is an evolutionarily conserved member of MAPK family that is activated in response to wide range of extracellular stimuli. The ERK pathway controls fundamental cellular functions including cell proliferation, differentiation, apoptosis or cell motility. To control such a diverse cellular responses by a single pathway cells have evolved regulatory mechanisms that channel the extracellular signals towards the specific biological response. Crucial to this control are non- enzymatic proteins termed scaffolds that associate with and enhance functional interaction of the components of MAPK pathways and can regulate amplitude, timing, specificity and location of signals. Scaffold protein RACK1 associates with several components of cell migration machinery including integrins, FAK, Src and the ERK pathway core protein kinases. RACK1 regulates distinct steps of cell migration such as establishment of cell polarity and focal adhesion turnover, however, the molecular mechanism by which RACK1 regulates these processes remains largely unknown. The main aim of this study was to investigate the functional role of RACK1 in cell motility, in particular to identify new effector proteins utilized by the ERK pathway and RACK1 in the regulation of...
Citace dokumentu
Metadata
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Applications of graph theory in protein function prediction
Defence status: DEFENDEDKalábová, Nikola (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2021)Date of defense: 8. 6. 2021Rapidní vývoj celogenomových sekvenačních metod a jejich snižující se cena za- příčinila existenci velkého množství osekvenovaných genomů. Vývoj spolehlivých in-silico metod pro anotaci rychle rostoucího počtu osekvenovaných ... -
Funkční studie potenciální nukleotidázy kódované genem spr1057 Streptococcus pneumoniae, homologa proteinu YjjG E. coli
Defence status: DEFENDEDVacková, Zuzana (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2010)Date of defense: 31. 5. 2010ČESKÝ ABSTRAKT Funkční studie potenciální nukleotidasy kódované genem spr1057 v Streptococcus pneumoniae, homologa proteinu YjjG Escherichia coli. Bakteriální buňky jsou neustále vystavovány nespočetným toxickým látkám, ... -
Role of the ubiquitin-like protein, Hub1, in the pre-mRNA splicing regulation
Defence status: DEFENDEDHubáčková, Tereza (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2018)Date of defense: 4. 6. 2018Splicing is a key step of eukaryotic gene expression and as well as other steps of this vital process, splicing has to be tightly regulated. Hub1 protein is a ubiquitin-like protein which noncovalently interacts with ...