Populační struktura afrických populací hodnocená pomocí Alu inzercí.
Population Structure of African Populations Inferred from Alu Insertions.
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/46245Identifiers
Study Information System: 98382
Collections
- Kvalifikační práce [20097]
Author
Advisor
Referee
Frynta, Daniel
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Anthropology and Human Genetics
Department
Department of Anthropology and Human Genetics
Date of defense
11. 6. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Alu inzerce, Fulbové, populační genetika, sahelKeywords (English)
Alu insertions, Fulani, population genetics, SahelPopulačně-genetická studie byla provedena na 188 nepříbuzných jedincích z 5 sahelských populací. Pomocí 16 polymorfních Alu inzercí byl studován vztah pasteveckých Fulbů k usedlým populacím různého jazykového pozadí a různého geografického původu. Tato bialelická multilokusová data byla vhodná i k aplikaci bayesiánského klastrovacího přístupu. Byla zjištěna divergence Fulbů od usedlých populací západoafrického sahelu (Kassenů a Mossiů) a podobnost s východoafrickými Somálci. V kontextu dosud získaných genetických dat je možné interpretovat tyto výsledky jako možný doklad saharského původu fulbské diaspory, k níž došlo v souvislosti s vysycháním Sahary před 6 000 lety. Po původní migraci této pastevecké populace do západní Afriky muselo ovšem docházet k integraci převážně žen (genovému toku mtDNA) z lokálních zdrojů. Songhajská populace vykazovala na rozdíl od fulbské signál recentního míšení, které odpovídá jazykovým a historickým závěrům. KLÍČOVÁ SLOVA Alu inzerce, Fulbové, populační genetika, sahel
The population genetic study was carried out on 188 unrelated individuals from 5 populations of the Sahel. Relationships of nomadic Fulani to sedentary populations of different linguistic backgrounds and geographic origins were inferred from 16 polymorphic Alu insertions. Bayesian clustering approaches could be applied due to biallelic multilocus nature of the data. Fulani were shown to be divergent from neighbouring sedentary populations (Kassena and Mossi) and similar to Somali of East Africa. In context of already published genetic data, these results could be interpreted as Saharan origin of Fulani diaspora that was caused by Sahara drying out around 6 000 BP. After this initial migration of nomads to West Africa, a primarily female gene flow (integration of females) must have influenced the Fulani population. In contrast to Fulani, Songhai have shown a signal of recent admixture in concordance with historical and linguistic assumptions. KEY WORDS Alu insertions, Fulani, population genetics, Sahel