Molekulárně genetické vyšetření CFTR genu v rámci novorozeneckého screeningu v České republice

Abstract

5 Souhrn Cystická fibróza (CF) je nejčastější závažné autozomálně recesivní genetické onemocnění. Je způsobena mutací/cemi v genu kódujícím chloridový transportér na buněčné membráně (66). Statistiky uvádějí, že se toto onemocnění objevuje u jednoho z 2500 až 3500 živě narozených dětí v evropských populacích, přičemž v České republice se takto postižených dětí narodí asi 40 za rok (63). S ohledem na velmi závažné klinické projevy nemoci, které výrazně zkracují život postiženého, se u všech novorozenců narozených na území ČR od 1. října 2009 provádí novorozenecký screening CF ze suché kapky krve. Krevní vzorky novorozenců, kteří mají v prvotním testu zvýšené hodnoty IRT na daný cut off, jsou zasílány do laboratoře molekulární genetiky k analýze nejčastějších, patogenních a populačně významných mutací v genu CFTR. Izolace DNA se provádí ze stejných suchých kapek krve na screeningové kartičce, ve kterých byla zjištěna zvýšená koncentrace IRT. Důležitý je správný výběr izolační metody, s ohledem na výtěžnost a kvalitu DNA. Ta zásadně ovlivní kvalitu a rychlost výsledků molekulárně genetického vyšetření a má vliv na následné získaní informací během molekulárně genetické analýzy. U postižených jedinců jsou nalézány 2 mutace, event. 1 mutace v homozygotním stavu v genu CFTR v pozici trans. Do dnešního dne bylo...

6 Summary Cystic fibrosis (CF) is the most frequent serious autosomal recessive genetic disease. CF is caused by mutations in the gene coding for Chloride transporter on the cell membrane (66). According to the statistics, this disease has prevalence 1 in 2500 to 3500 live newborns in European populations, where in Czech republic about 40 affected children a year are born (63). With respect to very serious clinical symptoms of this disorder (which substantially shortens the life expectancy of affected individual) in all newborns born in Czech Republic since October 1, 2009 the newborn screening from the dry blot spot is being performed. Blood samples from newborns who have in the primary test increased levels of IRT over given cut off are being sent to molecular genetic laboratory for analysis of the most frequent, pathogenic and population-wise important mutations in the CFTR gene. DNA isolation is being performed from the same dry blood spots on the screening card, which correspond to those where the increased IRT were found. It is important to choose the most suitable isolation method with respect to DNA yield and concentration. Those are crucial for quality and turn around time of molecular genetic analysis results and influence the following information retrieval . There are 2 mutations found in...