Identifikace a studium exprese genů účastnících se kvetení u modelové rostliny merlík červený (Chenopodium rebrum)
Identification and expression of genes engaged in flowering of a model plant Chenopodium rubrum.
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/93745Identifiers
Study Information System: 75466
Collections
- Kvalifikační práce [20096]
Author
Advisor
Referee
Kovařík, Aleš
Smýkal, Petr
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
18. 6. 2009
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Pass
Souhrn Tatoprácesezabýá studiemmolekulrímíchzákladůfotoperiodickéindukcekveteníu modelovékátkodennírostlinymerlíkučerveného(Chenopodiumrubrum).Zaměřili jsme se na hledríLrria studiumexpresea fi.rrrkcehomologůgenůCoil,S77N,S(Co), FL)WERNG LoCUs r (FT) a LEAFY (LFY), klíčoýchregulátorůúčinkujícíchv signáni drázeindukce kvetenízávislénafotoperíoděu dlotltúenniArabidopsisthaliana. VtetraploidnímC' rubrwnjsme identifikovali dvaFT-lilre (FTL) geny_ CrFTL| a CrFTL2, lišícíse svými expresnímiprofily. CrFTL| by|o transkribovánoryÍnicky s maxímemuprostředdne.Za induktivníchfotoperiodiclcýchpodmínekkorelovalazr"ýšená expreseCrFTL| s míroukvetení'za neinduktivnichpodmínekneby|CrFTLI exprimován. ExpreseCrFTL2 byla za všechstudovanýchfotoperiodiclqýchrežimůkonstitutivn.CrFTL| je velmi pravděpodobněaktivátor kvďert, CzFTL2 se neúěastríkveteníza studovaných podmínekajehofunkcezůstrívánejasná. Dva Co-Iile (CoL) geny CrCoLL a CrCoL2 zC. rubrnt podléhajídosud nepopsanémutypu altemativníhosestřihua produkujídva t}py transkiptů.Jednaforma Íanskiptu ďpovídá standardnímusesřihu prvníhoajedinéhointronuv konzervovanépozici V druhéforměje navícvysťiŽena90 bp dlouhásekvenceodpovídajícíčástiprvníhoexonu' Všechnyět5rřiformy transkiptůvykazují stejnéřanskipční profily (ryErrickí exprese smaximemnakoncinoci)lišícísejenýškou...
Summary: Study presentedin this PhD thesis focusedon the molecularbasis of flowering inductionin a short-dayplantChenopodiumrubrum.We lookedfor respectivehomologsof CONSTANS (CO), FLOWERING LOCUS T (FZ) and LEAFT (LF"I) genes,which act as crucialregulatorsin thephotoperiod-dependentsignalpathvtayinArabidopsisthaliana. We identifiedtwoFT-like (FTL) genesCTFTL| aCTFTL2 ditreringin theirexpression pattemsin tefraploidC. rubrun. CTFTLI showedrhythmicexpressionpeakingin midday. ElevatedexpressionoÍCrFTL| wascorrelatedwithfloweringunderpermissivephotoperiodic treatnents,whereasit was not expressedat all undernon inductivephotoperiďic regimes' CrFTL2 showedconstitutiveexpression.CrFTL| verylikely playsa Íoleas a floral inducer, butthefunctionof CTFTL2remarnsunknown. Two CO-lil&e (COZ) genes CTCOLI a CTCOL2 identified inC. rubrum are altemativelysplicedandproducetwovariantsoftranscripts.Oneofthem wasstandardwith oneintronlocatedin conservativesite,theotheronehadanadditionalintronconespondingto the90bp regionofthe first exon.This typeofaltemativesplicinghasnotbeendescribedin other lnown CoL gercs. All forms of fanscripts show allmost identicď rhythmic Eanscriptionalpattsmspeakingat the end of the night and differ only in the level of individualmRNA. Light stronglyinhibitednanscriptionofboth CrCOtr genes. We have ďso...