Ap4A-RNA in IgE activated mast cells
Ap4A-RNA v IgE aktivovaných žírných buňkách
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/126289Identifikátory
SIS: 222177
Kolekce
- Kvalifikační práce [20064]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Černý, Jan
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Imunologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
1. 6. 2021
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
RNA čepičky, dinukleosid polyfosfáty, Ap4A, žírné buňky, RNA modifikace, IgEKlíčová slova (anglicky)
RNA caps, Dinucleoside polyphosphates, Ap4A, mast cells, RNA modification, IgE(CZ): Žírné buňky jsou buňkami imunitního systému přítomné ve tkáních. Mají širokou škálu funkcí a receptorů, včetně receptoru FcεRI, který se aktivuje vazbou na IgE navázaný na antigen. Když jsou buňky aktivovány tímto způsobem, jeden z procesů, který nastává je tzv. signální dráha LysRS-Ap4A-MITF, která vede k translokaci Lys tRNA syntetázy do buněčného jádra a aktivaci její nekanonické aktivity - tvorbě diadenosin tetrafosfátu (Ap4A). Ap4A je dinukleosid polyfosfát, typ molekul přítomných ve všech doménách života. Dinukleosid polyfosfáty se skládají ze dvou nukleosidů spojených dohromady 5 '- 5' fosfodiesterovým můstkem o různých délkách. Nedávno bylo prokázáno, že tyto molekuly slouží jako nekanonické iniciační nukleotidy transkripce u bakterií, kde fungují jako 5 'RNA čepičky, podobně jako dobře známá 7-methylguanosinová čepička eukaryotické mRNA. V této práci předkládám důkaz o existenci Ap 4A čepičkované RNA v žírných buňkách, 5' RNA struktuře, jejíž existence zatím nebyla popsána v eukaryotických buňkách, a pokouším se určit její roli při aktivaci těchto buněk a v širším kontextu imunitní odpovědi zprostředkované žírnými buňkami. Klíčová slova: žírné buňky, RNA čepičky, dinukleosid polyfosfáty, Ap4A, IgE, FcεRI receptor, Lys tRNA syntetáza
Mast cells are tissue resident members of the immune system. They have a wide range of functions and receptors including the FcεRI receptor, which gets activated by binding to IgE bound to an antigen. When the cells are activated in this manner, a process termed the LysRS- Ap4A-MITF signalling pathway occurs, resulting in the translocation of the Lys tRNA synthetase into the nucleus and an activation of its moonlighting activity - the production of diadenosine tetraphosphate (Ap4A). Ap4A is a dinucleoside polyphosphate, a type of ubiquitous molecule present in all domains of life. They are made up of two nucleosides joined together by a 5' to 5' phosphodiester bridge of variable lengths. Recently, these molecules have been shown to serve as non-canonical initiating nucleotides during bacterial transcription, where they function as 5' RNA caps, similar to the well-known 7- methylguanosine eukaryotic mRNA cap. In this thesis, I present proof of existence of Ap 4A capped RNA in mast cells, a previously unknown 5' RNA structure in eukaryotic cells, and I attempt to pinpoint its role in the activation of these cells and in the wider context of mast cell mediated immune response. Keywords: mast cells, RNA caps, Dinucleoside polyphosphates, Ap 4A, RNA modification, IgE, FcεRI receptor, Lysine tRNA synthetase