dc.contributor.advisor | Veis, Libor | |
dc.creator | Brandejs, Jan | |
dc.date.accessioned | 2024-12-28T10:54:23Z | |
dc.date.available | 2024-12-28T10:54:23Z | |
dc.date.issued | 2022 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/172273 | |
dc.description.abstract | Navzdory obrovskému pokroku v posledních desetiletích zůstává přesný popis silně ko- relovaných molekul dodnes výzvou. Abychom to změnili, vyvinuli jsme masivně paralelní implementaci metody DMRG, program MOLMPS. Pro takové nerelativistické systémy, které vyžadují přesný popis jak statické tak i dynamické korelace jsme rozšířili MOLMPS na téměř linerárně škálující metodu DLPNO-TCCSD. V relativistické oblasti jsme první, kdo použil čtyřkomponentí metodu CCSD ke korekci popisu dynamické korelace v DMRG. Výsledná metoda se nazývá 4c-TCCSD. Použití programu MOLMPS jsme demonstrovali na obtížných systémech, např. pro π-konjugovaný tetramer anthracenu s aktivním pro- storem CAS(63,63) a kofaktor FeMoco s CAS(113,76). Tyto výpočty ukázaly, že par- alelizace v vykazuje dobré škálování až na úroveň přibližně 2000 procesorových jader. Na příkladu modelu molekuly porfyrinu jsme demonstrovali, že metoda DLPNO-TCCSD dokáže popsat 99,9 % korelační energie získané původní metodou TCCSD. Naše rela- tivistická studie spektroskopických vlastností těžkých biatomik ukázala, že metoda 4c- TCCSD zvyšuje přesnost oproti CCSD až na řád CCSD(T), a že má v relativistické oblasti potenciál. Tato poráce pojednává o třech různých implementacích kvantově chemických metod založených na QC-DMRG. 1 | cs_CZ |
dc.description.abstract | Despite an immense progress in recent decades, a precise treatment of strongly corre- lated molecular systems still remains a challenge as of today. To help solve this problem, we have developed a massively parallel implementation of DMRG, called MOLMPS. For nonrelativistic systems requiring accurate treatment of both static and dynamical corre- lation, we have extended MOLMPS by the means of the almost linear scaling DLPNO- TCCSD method. In relativistic domain, we are the first who employed the 4c-CCSD to add dynamical correlation on top of DMRG, yielding the 4c-TCCSD method. When tested on benchmarks like the π-conjugated anthracene tetramer with CAS(63,63) and the FeMoco cofactor with CAS(113,76). We showed a good parallel performance on up to about 2000 CPUs. On the example of Iron(II)-Porphyrin model, we showed that the DLPNO-TCCSD captures 99.9% of TCCSD correlation energy. Our spectroscopic study on heavy diatomics showed that the 4c-TCCSD approach increases the precision of underlying CCSD to the order of CCSD(T) and that it is a promising approach. The thesis discusses three different implementations of quantum chemical methods based on QC-DMRG. 1 | en_US |
dc.language | English | cs_CZ |
dc.language.iso | en_US | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
dc.subject | matrix product state|tensor networks|DMRG|quantum chemistry|strong correlation|parallelization|coupled clusters | en_US |
dc.subject | tenzorové sítě|DMRG|kvantová chemie|silně korelované problémy|paralelizace|metoda spřažených klastrů | cs_CZ |
dc.title | Tensor Network-based Computational Methods for Strongly Correlated Molecular Quantum Mechanics | en_US |
dc.type | dizertační práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2022 | |
dcterms.dateAccepted | 2022-03-25 | |
dc.description.faculty | Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Mathematics and Physics | en_US |
dc.identifier.repId | 177642 | |
dc.title.translated | Výpočetní metody založené na tenzorových sítích pro silně korelované systémy v kvantové chemii | cs_CZ |
dc.contributor.referee | Mančal, Tomáš | |
dc.contributor.referee | Pitoňák, Michal | |
thesis.degree.name | Ph.D. | |
thesis.degree.level | doktorské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Theoretical Physics, Astronomy and Astrophysics | en_US |
thesis.degree.discipline | Teoretická fyzika, astronomie a astrofyzika | cs_CZ |
thesis.degree.program | Theoretical Physics, Astronomy and Astrophysics | en_US |
thesis.degree.program | Teoretická fyzika, astronomie a astrofyzika | cs_CZ |
uk.thesis.type | dizertační práce | cs_CZ |
uk.faculty-name.cs | Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Mathematics and Physics | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | MFF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Teoretická fyzika, astronomie a astrofyzika | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Theoretical Physics, Astronomy and Astrophysics | en_US |
uk.degree-program.cs | Teoretická fyzika, astronomie a astrofyzika | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Theoretical Physics, Astronomy and Astrophysics | en_US |
thesis.grade.cs | Prospěl/a | cs_CZ |
thesis.grade.en | Pass | en_US |
uk.abstract.cs | Navzdory obrovskému pokroku v posledních desetiletích zůstává přesný popis silně ko- relovaných molekul dodnes výzvou. Abychom to změnili, vyvinuli jsme masivně paralelní implementaci metody DMRG, program MOLMPS. Pro takové nerelativistické systémy, které vyžadují přesný popis jak statické tak i dynamické korelace jsme rozšířili MOLMPS na téměř linerárně škálující metodu DLPNO-TCCSD. V relativistické oblasti jsme první, kdo použil čtyřkomponentí metodu CCSD ke korekci popisu dynamické korelace v DMRG. Výsledná metoda se nazývá 4c-TCCSD. Použití programu MOLMPS jsme demonstrovali na obtížných systémech, např. pro π-konjugovaný tetramer anthracenu s aktivním pro- storem CAS(63,63) a kofaktor FeMoco s CAS(113,76). Tyto výpočty ukázaly, že par- alelizace v vykazuje dobré škálování až na úroveň přibližně 2000 procesorových jader. Na příkladu modelu molekuly porfyrinu jsme demonstrovali, že metoda DLPNO-TCCSD dokáže popsat 99,9 % korelační energie získané původní metodou TCCSD. Naše rela- tivistická studie spektroskopických vlastností těžkých biatomik ukázala, že metoda 4c- TCCSD zvyšuje přesnost oproti CCSD až na řád CCSD(T), a že má v relativistické oblasti potenciál. Tato poráce pojednává o třech různých implementacích kvantově chemických metod založených na QC-DMRG. 1 | cs_CZ |
uk.abstract.en | Despite an immense progress in recent decades, a precise treatment of strongly corre- lated molecular systems still remains a challenge as of today. To help solve this problem, we have developed a massively parallel implementation of DMRG, called MOLMPS. For nonrelativistic systems requiring accurate treatment of both static and dynamical corre- lation, we have extended MOLMPS by the means of the almost linear scaling DLPNO- TCCSD method. In relativistic domain, we are the first who employed the 4c-CCSD to add dynamical correlation on top of DMRG, yielding the 4c-TCCSD method. When tested on benchmarks like the π-conjugated anthracene tetramer with CAS(63,63) and the FeMoco cofactor with CAS(113,76). We showed a good parallel performance on up to about 2000 CPUs. On the example of Iron(II)-Porphyrin model, we showed that the DLPNO-TCCSD captures 99.9% of TCCSD correlation energy. Our spectroscopic study on heavy diatomics showed that the 4c-TCCSD approach increases the precision of underlying CCSD to the order of CCSD(T) and that it is a promising approach. The thesis discusses three different implementations of quantum chemical methods based on QC-DMRG. 1 | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
thesis.grade.code | P | |
dc.contributor.consultant | Pittner, Jiří | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |
uk.embargo.reason | Protection of the legitimate interests of third parties worthy of special consideration | en |
uk.embargo.reason | Ochrana oprávněných zájmů třetích osob hodných zvláštního zřetele | cs |
uk.thesis.defenceStatus | O | |
uk.departmentExternal.name | Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v.v.i. | cs |
dc.identifier.lisID | 9925471788206986 | |