Cirkadiánní systém a m6A metylace RNA
Circadian system and m6A RNA methylation
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/194331Identifikátory
SIS: 241826
Kolekce
- Kvalifikační práce [20089]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Filipovská, Eva
Oponent práce
Hlaváčková, Markéta
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Neurobiologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra fyziologie
Datum obhajoby
13. 9. 2024
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
cirkadiánní systém, RNA metylace, demetyláza, Per2:LUC myši, hodinové geny, primární kultury, mozekKlíčová slova (anglicky)
circadian system, RNA methylation, demethylase, Per2:LUC mice, clock genes, primary cultures, brainModifikace mRNAm6 Ametylací byla poprvé objevena v 70. letech minulého století a současné studie ukazují její význam v řadě fyziologických funkcí. Jedním ze studovaných funkcí m6 A metylace mRNA je její vliv na regulaci cirkadiánního systému a hodinových genů. Na m6 A metylaci se podílejí m6 A metylázy a metylace je zpětně odstranitelná m6 A demetylázami. Demetyláza ALKBH5 vykazuje význam ve spermatogenezi, rakovině, vývoji mozku a v klinické depresi. Naše studie sledovala vliv inhibice ALKBH5 v centrálním regulátoru cirkadiánního systému suprachiasmatických jader v potkanech a v PER2::LUC myších. Efekt inhibice ALKBH5 byl sledován na expresi hodinových genů Per2, Bmal1, Nr1d1, a dále genů Socs3, Stat3, Gfap a Fto. Klíčová slova: cirkadiánní systém, m6 A metylace, ALKBH5, SCN, hodinové geny
The modification of mRNA by m6 A methylation was first discovered in the 1970s and current studies show its role in various physiological processes. One of the studied functions of m6 A methylation is its role in regulation of the circadian system and clock genes. The m6 A methylation is catalysed by m6 A methylases. This methylation can be reversed by m6 A demethylases. The demethylase ALKBH5 plays a role in spermatogenesis, cancer, the brain development and major depressive disorder. Here, we study the effect of ALKBH5 inhibiton in the central regulatory component of the circadian system, the suprachiasmatic nucleus of rats and PER2::LUC mice. We studied what effect ALKBH5 inhibition has on the expression of clock genes Per2, Bmal1, Nr1d1 and also genes Socs3, Stat3, Gfap and Fto. Keywords: circadian system, m6 A methylation, ALKBH5, SCN, clock genes