Cirkadiánní systém a m6A metylace RNA
Circadian system and m6A RNA methylation
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/194331Identifiers
Study Information System: 241826
Collections
- Kvalifikační práce [20091]
Author
Advisor
Consultant
Filipovská, Eva
Referee
Hlaváčková, Markéta
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Neurobiology
Department
Department of Physiology
Date of defense
13. 9. 2024
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
cirkadiánní systém, RNA metylace, demetyláza, Per2:LUC myši, hodinové geny, primární kultury, mozekKeywords (English)
circadian system, RNA methylation, demethylase, Per2:LUC mice, clock genes, primary cultures, brainModifikace mRNAm6 Ametylací byla poprvé objevena v 70. letech minulého století a současné studie ukazují její význam v řadě fyziologických funkcí. Jedním ze studovaných funkcí m6 A metylace mRNA je její vliv na regulaci cirkadiánního systému a hodinových genů. Na m6 A metylaci se podílejí m6 A metylázy a metylace je zpětně odstranitelná m6 A demetylázami. Demetyláza ALKBH5 vykazuje význam ve spermatogenezi, rakovině, vývoji mozku a v klinické depresi. Naše studie sledovala vliv inhibice ALKBH5 v centrálním regulátoru cirkadiánního systému suprachiasmatických jader v potkanech a v PER2::LUC myších. Efekt inhibice ALKBH5 byl sledován na expresi hodinových genů Per2, Bmal1, Nr1d1, a dále genů Socs3, Stat3, Gfap a Fto. Klíčová slova: cirkadiánní systém, m6 A metylace, ALKBH5, SCN, hodinové geny
The modification of mRNA by m6 A methylation was first discovered in the 1970s and current studies show its role in various physiological processes. One of the studied functions of m6 A methylation is its role in regulation of the circadian system and clock genes. The m6 A methylation is catalysed by m6 A methylases. This methylation can be reversed by m6 A demethylases. The demethylase ALKBH5 plays a role in spermatogenesis, cancer, the brain development and major depressive disorder. Here, we study the effect of ALKBH5 inhibiton in the central regulatory component of the circadian system, the suprachiasmatic nucleus of rats and PER2::LUC mice. We studied what effect ALKBH5 inhibition has on the expression of clock genes Per2, Bmal1, Nr1d1 and also genes Socs3, Stat3, Gfap and Fto. Keywords: circadian system, m6 A methylation, ALKBH5, SCN, clock genes