Charakterizace faktorů biogeneze endoplazmatického retikula u Giardia intestinalis.
Characterization of the components involved in the biogenesis of the endoplasmic reticulum in Giardia intestinalis.
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/194852Identifikátory
SIS: 242344
Kolekce
- Kvalifikační práce [20091]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Gahura, Ondřej
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Parazitologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra parazitologie
Datum obhajoby
18. 9. 2024
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
Giardia intestinalis, Guided Entry of Tail-anchored proteins, tail-anchored proteiny, endoplazmatické retikulum, Get1, pull-down, knock-outKlíčová slova (anglicky)
Giardia intestinalis, Guided Entry of Tail-anchored proteins, tail-anchored proteins, endoplasmic reticulum, Get1, pull-down, knock-outAnaerobní prvok Giardia intestinalis je nejčastějším střevním parazitem člověka. Parazitický způsob života a evoluční odlišnost vedly u G. intestinalis k pozoruhodným adaptacím buněčných kompartmentů a metabolických drah. Z tohoto důvodu představuje G. intestinalis unikátní modelový organismus pro studium evoluce základních buněčných drah. Tou je i Guided Entry of Tail-anchored proteins (GET) dráha, která u eukaryot zaručuje post- translační vkládání tzv. tail-anchored (TA) proteinů do endoplazmatického retikula (ER). Pro TA proteiny je charakteristická C-terminální transmembránová doména, která zároveň působí jako targetovací sekvence pro transport do membrány ER. Mezi funkce TA proteinů patří fúze membrán, translokace proteinů či regulace apoptózy. GET dráha je nejlépe charakterizovaná u kvasinek a savců, avšak téměř všechny její komponenty již byly identifikovány i u G. intestinalis. Malá pozornost však byla dosud věnována proteinu Get1, který figuruje v konečných krocích GET dráhy jako inzertáza. U G. intestinalis se jedná o jediného zástupce tzv. Oxa1 superrodiny inzertáz, které zajišťují ko- i post-translační inzerci proteinů do membrán organel. Proto je Get1 hlavním tématem této diplomové práce. Klíčová slova: Giardia intestinalis, Guided Entry of Tail-anchored proteins, tail-anchored...
The anaerobic protist Giardia intestinalis is the most common intestinal parasite of human. Parasitic life style and evolutionary divergence have led to remarkable adaptations of cellular compartments and metabolic pathways in G. intestinalis. For this reason, G. intestinalis represents a unique model organism for studying the evolution of fundamental cellular pathway that plays a key role in the post-translational insertion of tail-anchored proteins (TAs) to the endoplasmic reticulum (ER) in eukaryotes called Guided Entry of Tail-anchored proteins (GET) pathway. TAs carry a single C-terminal transmembrane domain which also serves as a targeting sequence for the insertion to the ER membrane. TA protein functions include membrane fusion, protein translocation and regulation of apoptosis. GET pathway is well studied in yeast and mammals but almost all of the GET pathway components have been identified in G. intestinalis. However, not much attention was paid to Get1 protein which plays part in the final steps of GET pathway as the membrane insertase. It is also the only member of Oxa1 superfamily of insertases found in G. intestinalis which are mediating co- and post- translational insertion of proteins to organelle membranes. That makes Get1 the main topic of this thesis. Key words: Giardia...