Cytogenomics of the family Pipidae: an evolutionary fate and mechanisms of chromosomal rearrangements.

Abstract

in Czech Díky svým charakteristikám jsou žáby rodu Xenopus velmi užitečným modelem pro velké množství studií. Díky velké rozmanistosti v polyploidii u různých žab jsou velmi dobrým modelem pro studii cytogenetiky a evoluční analýzu. Tento project se zabývá evoluční dynamikou chromozomálních přestaveb v rámci rodiny Pipidae, zaměřující se především na členy rodu Xenopus, Silurana a a Hymenochirus. Zaměřili jsme se na stadium morfologie chromozomů a přestaveb u alotetraploidní žáby, Xenopus calcaratus, odhalující změny v rámci jejích dvou subgenomů. Subgenom "a" je vice konzervovaný, oproti subgenomu "b", který se vyvíjel rychleji. Specifická chromozomální translokace pozorovaná u X. mellotropicalis, ale ne u X. calcaratus, zdůrazňuje rozdíly v chromozomálních přestavbách mezi těmito druhy. Navrhli jsme scenář, že jediná alotetraploidizační událost vedla ke vzniku X. mellotropicalis, X. epitropicalis a X. calcaratus, přičemž k translokaci došlo po divergenci X. calcaratus, ale předspeciaci X. mellotropicalis a X. epitropicalis. Další scénář zahrnuje dvě nezávislé události alotetraploidizace. Dále jsme se zaměřili na roly polyploidizačních událostí a divergence ve vývoji repetitivních sekvencí u šesti druhů afrických drápatých žab. Kombinací cytogenetických a genomických analýz jsme namapovali U1 a...