Reservoirs and diversity of the crayfish plague pathogen: from Central Europe to its native range

Abstract

Patogen račího moru Aphanomyces astaci způsobuje úbytek původních populací raků v Evropě i jinde v Palearktu a představuje vážnou hrozbu i pro akvakultury raků, kteří jsou vůči račímu moru citliví. Pochopení vztahu mezi hostiteli a A. astaci, způsobů jeho zavlékání a epidemiologie je nezbytné pro přijetí vhodných strategií ochrany raků. Má doktorská práce se zaměřuje na rozšíření, prevalenci a diverzitu A. astaci v populacích původních evropských raků i v severoamerických druhů, a to jak v Evropě, tak i v původním areálu výskytu patogenu v USA. Klíčové výsledky mého výzkumu jsou shrnuty ve čtyřech hlavních kapitolách, které doplňují tři další spoluautorské publikace. Studie využívají řadu molekulárních metod ke zkoumání genetické variability A. astaci a vztahují výskyt nalezených genotypů patogenu s hostitelskými druhy a zeměpisnými oblastmi. Klíčové výsledky disertační práce zahrnují identifikaci neočekávaných kmenů A. astaci, které se podílely na nedávných úhynech raků na račí mor v Česku, charakterizaci nového genotypu A. astaci v populacích původně akvarijních druhů raků v Maďarsku, vyhodnocení relativní stability prevalence A. astaci v populacích jejich hostitelů v čase nebo potvrzení, že charakter míry infekce A. astaci je obdobný v populacích invazních severoamerických raků v Evropě i v...

The crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci is causing declines in native crayfish populations across the Palaearctic and poses a serious threat to aquaculture of susceptible crayfish species. Understanding the host-pathogen relationship of A. astaci, its introduction pathways and epidemiology is essential for the adoption of appropriate conservation strategies for A. astaci-susceptible crayfish worldwide. My PhD thesis focuses on the distribution, prevalence and diversity of A. astaci in native European crayfish populations, as well as in North American crayfish populations both in Europe and in the pathogen's native range in the USA. The key results of my research are provided in four core chapters, which are supplemented by three additional co-authored publications. The studies use multiple molecular tools to explore the genetic variability of A. astaci, linking genotype patterns to host species and geographical regions. The key findings included the identification of unexpected A. astaci strains involved in crayfish plague outbreaks in Czechia and novel A. astaci genotype in populations of non- native aquarium crayfish species in Hungary, evaluation of relative stability in A. astaci infection rates in populations of their hosts over time, and revealing comparable patterns of A. astaci...