Sestřih atypických intronů v S. cerevisiae

Abstract

Sestřih pre-mRNA je životně důležitý proces významný pro genovou expresi všech eukaryotických organismů. Pro správný průběh tohoto velmi složitého a dynamického děje je zapotřebí několik specializovaných RNA a velké množství proteinů, které zastávají nejrůznější úlohy nejen přímo uvnitř samotného sestřihového komplexu, ale i mimo něj. Jedním z proteinů účastnících se sestřihu pre-mRNA v kvasince Saccharomyces cerevisiae je i Prp45. Jeho lidským homologem je protein SNW1/SKIP, který se mimo sestřihu podílí i na celé řadě dalších funkcí. U proteinu Prp45 byla zatím spolehlivě popsána pouze účast na druhé transesterifikační reakci sestřihu. Objevily se však i informace naznačující jeho možné zapojení do první transesterifikační reakce. Tato práce přináší další poznatky spojující protein Prp45 s prvním sestřihovou reakcí, které byly získány výzkumem buněk nesoucích mutantní alelu prp45(1-169). Buňky nesoucí tuto alelu vykazují mimo zhoršeného sestřihu i akumulaci některých pre-mRNA. Tato práce se proto zabývala i možným vlivem proteinu Prp45 na export RNA z jádra do cytoplasmy. Nebylo však objeveno žádné spojení mezi transportem RNA a tímto proteinem. Klíčová slova sestřih pre-mRNA; Saccharomyces cerevisiae; Prp45; Mer1; Mud2; Prp22; Rrp6; AMA1; SNW1/SKIP

Pre-mRNA splicing is a vital process of gene expression important for all eukaryotic organisms. For the proper function of this very complex and dynamic event the presence of few specialized RNA and many proteins that hold a variety of tasks is necessary, not only inside the splicing complex itself, but also beyond this complex. The Prp45 is one of the proteins involved in pre-mRNA splicing in yeast Saccharomyces cerevisiae. Its human homologue, SNW1/SKIP, is involved in splicing but also in other crucial cell processes. The Prp45 protein was reliably reported only to participate in the second transesterification reaction of splicing. But there are also data suggesting its possible involvement in the first transesterification reaction. This work provides further evidences linking protein Prp45 with the first splicing reaction, obtained by the research of cells carrying the mutant allele prp45(1-169). Cells carrying this allele show dropped splicing and accumulation of pre-mRNAs. This thesis therefore also investigated the possible influence of Prp45 protein on the RNA export from the nucleus to the cytoplasm. But no connection between this protein and RNA transport was discovered. Keywords pre-mRNA splicing; Saccharomyces cerevisiae; Prp45; Mer1; Mud2; Prp22; Rrp6; AMA1; SNW1/SKIP