Molekulárně genetická analýza u Niemann-Pickovy choroby typu C

Abstract

Niemann-Pickova choroba typu C je velice závažné onemocnění s autozomálně recesivním typem dědičnosti. Příčinou nemoci jsou patogenní mutace nacházející se v genech NPC1/NPC2. Tyto geny kódují lysozomální neenzymatické NPC1/NPC2 proteiny, které se podílejí na transportu lipidů. V důsledku deficitu těchto proteinů dochází k intracelulárnímu hromadění lipidů, především neesterifikovaného cholesterolu a glykolipidů. Kauzální terapie je v současnosti neuspokojivá, vyvíjejí se proto nové léčebné postupy. Některé z nich závisí na tom, zda se v buňkách pacientů vyskytuje alespoň zbytkové množství transkriptu genu NPC1. U vybraných pacientů, u kterých byla k dispozici kultura kožních fibroblastů, jsem charakterizovala vliv patogenních mutací na množství transkriptu. Výsledky ukázaly, že u všech patogenních mutací je množství transkriptu detekovatelné. Současně jsem charakterizovala strukturu promotoru genu NPC1. Sekvenační analýzou jsem v promotoru nalezla polymorfizmy rs8099071, rs28403610, rs2981422, rs1652354, rs1788774, rs1788772. Analyzovala jsem skladbu polymorfizmů u jednotlivých pacientů, výsledky svědční pro existenci šesti různých haplotypů. U nově diagnostikované pacientky jsem mutační analýzu nalezla pouze jednu patogenní mutaci p.I1061T (c.3182T>C) v genu NPC1. Z tohoto důvodu jsem pomocí...

Niemann-Pick disease type C (NPC) is a rare, severe disease with autosomal recessive inheritance. Disease is caused by pathogenic mutations located in genes NPC1/NPC2. These genes encode lysosomal non enzymatic NPC1/NPC2 proteins that are part of lipid transport. As a result of malfunction of these proteins intracellular accumulation of lipids occurs, in particular free cholesterol and glycolipids. Causal therapy is currently still unsatisfactory therefore new therapies are evolved. However these therapies depend on whether the patient cells contain at least residual amount of transcript NPC1 gene. In a group of patiens, for which a fibroblast culture was available, I analyzed the effect of pathogenic mutations on the expression level of the transcript. Results showed that for all pathogenic mutations transcript level is low, but detectable. Moreover, I characterized the structure of the NPC1 gene promoter. By sequence analysis I found polymorphisms rs8099071, rs28403610, rs2981422, rs1652354, rs1788774, rs1788772 in promoter. On the basis of the composition of polymorphisms in individual patiens, I estimate six different haplotypes. I performed mutation analysis in DNA of recently diagnosed patient. I found only one pathogenic mutation p.I1061T (c.3182T> C) in the NPC1 gene. Therefore I tested...