Preparation of Monoclonal Antibodies Against VP2 Protein of Human Polyomaviruses

Abstract

Cílem této diplomové práce bylo připravit dva proteinové antigeny a dvě monoklonální protilátky, založené na minoritním proteinu VP2 lidských polyomavirů BK viru a Polyomaviru karcinomu Merkelových buněk. Proběhla příprava monoklonální protilátky proti unikátní části proteinu VP2 BK viru (N-koncový epitop, který se nenachází u proteinu VP3). Buněčná linie produkující protilátku s touto specificitou nebyla zatím nikdy ustavena kvůli nízké imunogenicitě tohoto epitopu. Náš přístup byl z hlediska imunizace myší úspěšný, ale později v průběhu přípravy nastaly vážné problémy se stabilitou hybridomové linie. Dalším cílem této práce byla příprava monoklonální protilátky cílené na sekvenci proteinu VP2 Polyomaviru karcinomu Merkelových buněk. Imunizace myší a hybridomová fúze byly provedeny úspěšně. Po čtyřech kolech klonování za účelem přípravy ustaveného klonu bylo devět klonů vybráno k rozpěstování. Rozpěstování pravděpodobně vedlo ke snížení specificity protilátky a ke ztrátě produkce u většiny hybridomů. Jednou zopakované klonování by mělo vyústit v získání ustaveného klonu s dostatečnou produkcí. Příprava dvou proteinových antigenů byla provedena ve dvou expresních systémech. DNA kódující VP2 protein BK viru zkrácený na C-konci a fúzovaný s His-tagem byla klonována do vektoru vhodného pro expresi v...

Aim of this diploma thesis was to prepare two protein antigens and two monoclonal antibodies, all based on VP2 minor protein of human polyomaviruses BK virus and Merkel Cell Polyomavirus. One monoclonal antibody was being prepared against unique part of VP2 protein (N-terminal epitope, not present in VP3 protein). A cell line producing such monoclonal antibody has never been established before due to low immunogenicity of the epitope. Our approach was successful in terms of mouse immunization, however, serious problems with hybridoma line stability appeared later during the preparation process. Preparation of antibody targeted to the sequence of VP2 protein of Merkel Cell Polyomavirus was another aim of this thesis. Mouse immunization and hybridoma fusion were performed successfully. After four rounds of cloning in order to purify an established clone, nine clones were cultivated in larger scale. This cultivation probably led to diminished antibody specificity and loss of production ability in most of the hybridoma cells. One more cloning should give rise to an established clone with sufficient production. Two preparations of protein antigens were performed in two expression systems. DNA encoding C-terminally truncated protein VP2 of BK virus fused with His-tag was cloned into a vector suitable for...