O hybridním původu Chenopodium album

Abstract

Práce se zabývá genetickou variabilitou a evolučními vztahy mezi vybranými druhy skupiny Chenopodium album a původem hexaploidního druhu Ch. album. Hlavní otázkou této studie bylo, zda na území České republiky dochází k recentnímu vzniku Ch. album s. str. ve smíšených populacích pěti druhů, reprezentovaných na diploidní úrovni druhy Ch. ficifolium a Ch. suecicum, na tetraploidní úrovni Ch. strictum a Ch. striatiforme a na hexaploidní úrovni druhem Ch. album. K zodpovězení těchto otázek byly použity mikrosatelitové markery, které jsou pro odhalení rodičovských linií vhodné. Jelikož pro danou skupinu nebyly vyvinuty žádné mikrosatelitové primery, bylo nutné si je na počátku studia vyvinout a to přenosem z blízce příbuzného druhu Ch. quinoa. Přenosem mikrosatelitových primerů se podařilo sestavit tři multiplex PCR, které byly testovány na reprezentativním vzorku, na kterém byla odhadnuta genetická variabilita mikrosatelitových lokusů. Pomocí optimalizovaných mikrosatelitových markerů bylo analyzováno celkem 911 jedinců nasbíraných z pěti lokalit v České republice. Výsledky analýz ukázaly na (1) vysokou mezidruhovou diferenciaci, (2) genový tok mezi druhy stejných ploidních úrovní, (3) přítomnost kříženců jak mezi diploidními druhy Ch. ficifolium a Ch. suecium, tak i mezi tetraploidními druhy Ch. strictum a Ch....

Diploma thesis deals with genetic variability and evolutionary relationships among selected species of the group Chenopodium album and is especially focused on the origin of hexaploid species C. album in the Czech Republic. The main aim of the study was detection of putative recent emergence of hexaploid C. album s. str. in mixed populations of diploid (C. ficifolium and C. suecicum) and tetraploid (C. strictum and C. striatiforme) species. To assess phylogenetical relationships I performed an analysis of nuclear microsatellite loci, that are suitable for detection parental lines within polyploid species. As long as microsatellite primers have been developed for studied group, therefore they had to be cross-amplified from closely related species C. quinoa. Three PCR multiplexes were assembled by cross-amplification of microsatellite primers. These PCR multiplexes were tested on representative sample sets to estimate genetic variability of individual microsatellite loci. A total of 911 individuals were analyzed from five localities from the Czech Republic. The results of analyses revealed (1) high interspecific differentiation, (2) gene flow among species of the same ploidy levels, (3) presence of hybrids among diploid species of C. ficifolium and C. suecium as well as among tetraploid species C. strictum...