Molecular Characterisation of Parvalbumin Gene: Evolutionary Insights and Forensic Applications for Fish Species Identification and Authentication
Molekulární charakterisace parvalbuminového genu ryb: evoluční pohled a forenzní aplikace pro identifikaci a autentizaci druhů ryb
dizertační práce (OBHÁJENO)
![Neveřejný dokument](/bitstream/handle/20.500.11956/188710/thmb_private_cs.png?sequence=6&isAllowed=y)
Omezená dostupnost dokumentu
Celý dokument nebo jeho části jsou nepřístupné do 05. 04. 2026
Důvod omezené dostupnosti:
ochrana informací chráněných zvláštním zákonem
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/188710Identifikátory
SIS: 211395
Kolekce
- Kvalifikační práce [19588]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Musilová, Zuzana
Oponent práce
Kalous, Lukáš
Flajšhans, Martin
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Environmental Science
Katedra / ústav / klinika
Ústav pro životní prostředí
Datum obhajoby
6. 3. 2024
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
gen, parvalbumin, sekvence, paralog, pseudogen, PCR, klonováníKlíčová slova (anglicky)
gene, parvalbumin, sequence, paralog, pseudogene, PCR, cloningAbstract Parvalbumin (pvalb), a low molecular weight calcium-binding protein, plays a crucial role in regulating Ca2+ switching in fast-twitch muscle fibres and has been identified as a major cause of fish-induced food allergies. The molecular evolution of pvalb genes in teleost fish and its cause, duplication of the whole genome, was investigated, revealing high diversity and complex gene repertoires, making detection and identification challenging. This study provides robust genomic evidence of the complex evolution of parvalbumin genes in teleost fish. In addition to its role as a potent allergen, the pvalb gene, a nuclear gene, can serve as a valuable molecular marker. Keeping this in mind, a real-time PCR assay is developed to detect and quantify two European anglerfish species simultaneously, Lophius piscatorius and Lophius budegassa, which are susceptible to illegal species substitutions in the global seafood trade. The assay targets the intronic region of the pvalb gene, demonstrating high specificity, efficiency, and robustness, making it a potential forensic tool to prevent food fraud and ensure the accurate identification of fish species. Furthermore, a standardised quantitative PCR-based method is presented for the β-pvalb gene in Lophius piscatorius, utilising a plasmid DNA calibrator...