Hledaní nových interakčních partnerů SH3 domény adaptorového proteinu p130Cas
The search for novel interaction partners of SH3 domain of an adaptor protein p130Cas
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/46230Identifikátory
SIS: 96268
Kolekce
- Kvalifikační práce [20096]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Forstová, Jitka
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Buněčná a vývojová biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
6. 6. 2012
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
p130Cas, Src, SH3 doména, fosfomimikující mutace, Phage display, PKN3Klíčová slova (anglicky)
p130Cas, Src, SH3 domain, phosphomimic mutation, Phage display, PKN3Protein p130Cas patří mezi hlavní tyrosin-fosforylované proteiny v buňkách transformovaných onkogeny v-crk a v-src. Jeho exprese je nezbytná pro invazivitu a tvorbu metastází v buňkách transformovaných aktivovanou kinázou Src. Vysoké hladiny exprese proteinu p130Cas u pacientů s rakovinou prsu jsou spojeny s větším rizikem návratu choroby, slabou odpovědí na léčbu tamoxifenem a horší prognózou. V netransformovaných buňkách je p130Cas fosforylován v substrátové doméně po stimulaci integrinů, což ovlivňuje buněčnou migraci a dynamiku cytoskeletu. Na této signalizaci se nepostradatelně podílí právě SH3 doména p130Cas. V této diplomové práci jsme jako první analyzovali pomocí metody Phage display a následně charakterizovali vazebný motiv SH3 domény p130Cas. Na základě tohoto vysokoafinitního motivu [AP]P[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]-[LPST] jsme predikovali nové interakční partnery proteinu p130Cas a následně potvrdili interakci se Ser/Thr kinázou PKN3. Tato kináza kolokalizuje s p130Cas v jádře a perinukleární oblasti a mohla by p130Cas fosforylovat. V rámci této diplomové práce jsme také analyzovali vliv fosfomimikující mutace tyrosinu ze sekvence ALYD, která je konzervovaná v sekvenci SH3 domén, na schopnost těchto domén vázat ligandy. Tato mutace snižovala vazbu asi o 3 řády jak k ligandům I. třídy (SH3...
Protein p130Cas is the major tyrosine phosphorylated protein in cells transformed by v-crk and v-src oncogenes. P130Cas plays an important role in invasiveness and metastasis of Src-transformed cells. In breast cancer patients, high p130Cas levels are associated with higher recurrence of disease, poor response to tamoxifen treatment and lower overall survival. In non-transformed cells, after the stimulation of integrins, protein p130Cas is phosphorylated in substrate domain affecting cell migration and cytoskeletal dynamics. For this signalling is the SH3 domain of p130Cas indispensable. In this thesis, was for the first time using the Phage display method analysed and subsequently characterized the binding motif of SH3 domain of p130Cas. Based on this high-affinity motif [AP]-P-[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]- [LPST], we predicted new interaction partners of protein p130Cas and subsequently confirmed the interaction with the Ser/Thr kinase PKN3. This kinase colocalizes with p130Cas in the nucleus and perinuclear region and could phosphorylate p130Cas. In this thesis, we also analysed the effect of phosphomimicking mutation of tyrosine from sequence ALYD, which is conserved in the sequence of SH3 domains, on ability of these domains to bind ligands. This mutation reduced binding by about 3 orders of...