Zobrazit minimální záznam

The search for novel interaction partners of SH3 domain of an adaptor protein p130Cas
dc.contributor.advisorRösel, Daniel
dc.creatorGemperle, Jakub
dc.date.accessioned2017-05-07T20:37:01Z
dc.date.available2017-05-07T20:37:01Z
dc.date.issued2012
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/46230
dc.description.abstractProtein p130Cas patří mezi hlavní tyrosin-fosforylované proteiny v buňkách transformovaných onkogeny v-crk a v-src. Jeho exprese je nezbytná pro invazivitu a tvorbu metastází v buňkách transformovaných aktivovanou kinázou Src. Vysoké hladiny exprese proteinu p130Cas u pacientů s rakovinou prsu jsou spojeny s větším rizikem návratu choroby, slabou odpovědí na léčbu tamoxifenem a horší prognózou. V netransformovaných buňkách je p130Cas fosforylován v substrátové doméně po stimulaci integrinů, což ovlivňuje buněčnou migraci a dynamiku cytoskeletu. Na této signalizaci se nepostradatelně podílí právě SH3 doména p130Cas. V této diplomové práci jsme jako první analyzovali pomocí metody Phage display a následně charakterizovali vazebný motiv SH3 domény p130Cas. Na základě tohoto vysokoafinitního motivu [AP]­P­[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]-[LPST] jsme predikovali nové interakční partnery proteinu p130Cas a následně potvrdili interakci se Ser/Thr kinázou PKN3. Tato kináza kolokalizuje s p130Cas v jádře a perinukleární oblasti a mohla by p130Cas fosforylovat. V rámci této diplomové práce jsme také analyzovali vliv fosfomimikující mutace tyrosinu ze sekvence ALYD, která je konzervovaná v sekvenci SH3 domén, na schopnost těchto domén vázat ligandy. Tato mutace snižovala vazbu asi o 3 řády jak k ligandům I. třídy (SH3...cs_CZ
dc.description.abstractProtein p130Cas is the major tyrosine phosphorylated protein in cells transformed by v-crk and v-src oncogenes. P130Cas plays an important role in invasiveness and metastasis of Src-transformed cells. In breast cancer patients, high p130Cas levels are associated with higher recurrence of disease, poor response to tamoxifen treatment and lower overall survival. In non-transformed cells, after the stimulation of integrins, protein p130Cas is phosphorylated in substrate domain affecting cell migration and cytoskeletal dynamics. For this signalling is the SH3 domain of p130Cas indispensable. In this thesis, was for the first time using the Phage display method analysed and subsequently characterized the binding motif of SH3 domain of p130Cas. Based on this high-affinity motif [AP]-P-[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]- [LPST], we predicted new interaction partners of protein p130Cas and subsequently confirmed the interaction with the Ser/Thr kinase PKN3. This kinase colocalizes with p130Cas in the nucleus and perinuclear region and could phosphorylate p130Cas. In this thesis, we also analysed the effect of phosphomimicking mutation of tyrosine from sequence ALYD, which is conserved in the sequence of SH3 domains, on ability of these domains to bind ligands. This mutation reduced binding by about 3 orders of...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectp130Cascs_CZ
dc.subjectSrccs_CZ
dc.subjectSH3 doménacs_CZ
dc.subjectfosfomimikující mutacecs_CZ
dc.subjectPhage displaycs_CZ
dc.subjectPKN3cs_CZ
dc.subjectp130Casen_US
dc.subjectSrcen_US
dc.subjectSH3 domainen_US
dc.subjectphosphomimic mutationen_US
dc.subjectPhage displayen_US
dc.subjectPKN3en_US
dc.titleHledaní nových interakčních partnerů SH3 domény adaptorového proteinu p130Cascs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2012
dcterms.dateAccepted2012-06-06
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId96268
dc.title.translatedThe search for novel interaction partners of SH3 domain of an adaptor protein p130Casen_US
dc.contributor.refereeForstová, Jitka
dc.identifier.aleph001480074
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineCellular and Developmental Biologyen_US
thesis.degree.disciplineBuněčná a vývojová biologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBuněčná a vývojová biologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enCellular and Developmental Biologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csProtein p130Cas patří mezi hlavní tyrosin-fosforylované proteiny v buňkách transformovaných onkogeny v-crk a v-src. Jeho exprese je nezbytná pro invazivitu a tvorbu metastází v buňkách transformovaných aktivovanou kinázou Src. Vysoké hladiny exprese proteinu p130Cas u pacientů s rakovinou prsu jsou spojeny s větším rizikem návratu choroby, slabou odpovědí na léčbu tamoxifenem a horší prognózou. V netransformovaných buňkách je p130Cas fosforylován v substrátové doméně po stimulaci integrinů, což ovlivňuje buněčnou migraci a dynamiku cytoskeletu. Na této signalizaci se nepostradatelně podílí právě SH3 doména p130Cas. V této diplomové práci jsme jako první analyzovali pomocí metody Phage display a následně charakterizovali vazebný motiv SH3 domény p130Cas. Na základě tohoto vysokoafinitního motivu [AP]­P­[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]-[LPST] jsme predikovali nové interakční partnery proteinu p130Cas a následně potvrdili interakci se Ser/Thr kinázou PKN3. Tato kináza kolokalizuje s p130Cas v jádře a perinukleární oblasti a mohla by p130Cas fosforylovat. V rámci této diplomové práce jsme také analyzovali vliv fosfomimikující mutace tyrosinu ze sekvence ALYD, která je konzervovaná v sekvenci SH3 domén, na schopnost těchto domén vázat ligandy. Tato mutace snižovala vazbu asi o 3 řády jak k ligandům I. třídy (SH3...cs_CZ
uk.abstract.enProtein p130Cas is the major tyrosine phosphorylated protein in cells transformed by v-crk and v-src oncogenes. P130Cas plays an important role in invasiveness and metastasis of Src-transformed cells. In breast cancer patients, high p130Cas levels are associated with higher recurrence of disease, poor response to tamoxifen treatment and lower overall survival. In non-transformed cells, after the stimulation of integrins, protein p130Cas is phosphorylated in substrate domain affecting cell migration and cytoskeletal dynamics. For this signalling is the SH3 domain of p130Cas indispensable. In this thesis, was for the first time using the Phage display method analysed and subsequently characterized the binding motif of SH3 domain of p130Cas. Based on this high-affinity motif [AP]-P-[APMS]-K-P-[LPST]-[LR]- [LPST], we predicted new interaction partners of protein p130Cas and subsequently confirmed the interaction with the Ser/Thr kinase PKN3. This kinase colocalizes with p130Cas in the nucleus and perinuclear region and could phosphorylate p130Cas. In this thesis, we also analysed the effect of phosphomimicking mutation of tyrosine from sequence ALYD, which is conserved in the sequence of SH3 domains, on ability of these domains to bind ligands. This mutation reduced binding by about 3 orders of...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990014800740106986


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV