Up-regulation of microRNA miR-155 is reflected by low levels of its target mRNA encoding transcription factor PU.1 in primary tumors of human lymphomas
Zvýšená exprese mikroRNA miR-155 a snížená exprese její cílové mRNA kódující transkripční faktor PU.1 ve vzorcích tumorů z lidských lymfomů.
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/52726Identifikátory
SIS: 95647
Kolekce
- Kvalifikační práce [20097]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Mráz, Marek
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Imunologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
6. 6. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
mikroRNA, miR-155, PU.1, MYB, miR-150, lymfomy, genová exprese, PCRKlíčová slova (anglicky)
microRNA, miR-155, PU.1, MYB, miR-150, lymphoma, gene expression, PCRLymfomy jsou pevné nádory lymfocytů, především řady B. V některých lidských lymfomech byla zjištěna zvýšená hladiny mikroRNA miR-155. Tato mikroRNA je důležitá zejména v imunitní reakci, je však take schopna indukovat maligní lymfoproliferaci u myši. Jedním z patogenních mechanismů miR-155 v lymfomech je patrně snížení exprese transkripčního faktoru PU.1, který je v určité hladině nezbytný pro správnou diferenciaci B lymfocytů. Exprese miR-155 je v lymfomech aktivována různými transkripčními faktory, z nichž jedním je MYB z onkogenní rodiny E-box proteinů. Hladina MYB je zase regulována pomocí mikroRNA miR-150. Změřili jsme hladinu mikroRNA miR-155, PU.1, MYB a miR-150 ve vzorcích uzlin pacientů s lymfomy, konkrétně s diagnózami: chronická lymfocytární leukémie/lymfom z malých lymfocytů (B-CLL/SLL, N=20), difuzní velkobuněčný B lymfom (DLBCL, N=24), folikulární lymfom (FL, N=29), Hodgkinův lymfom (HL, N=25), lymfom marginální zóny (MZL, N=13) a lymfom buněk plášťové zóny (MCL, N=10). Expresi zmíněných molekul jsme změřili rovněž v lymfatických uzlinách s nálezem silného zánětu (N=4). Zjistili jsme, že hladina miR-155 je zvýšená u všech diagnóz mimo MCL, a že hladina PU.1 je naopak snížená. Naše výsledky dále naznačují, že hladina miR-155 a PU.1 v individuálních případech souvisí s některými klinickými či...
Lymphomas are heterogenous class of diseases characterized by proliferation of a malignant lymphocyte clone. MicroRNA miR-155 was found to be a key molecule in immune response, namely in inflammation and germinal reaction of B cells. On the other hand, miR-155 can drive lymphoproliferation in mouse and its levels were found to be elevated in certain lymphoma types in human. MiR-155 down-regulates expression of its target gene PU.1, a hematopoietic transcription factor important for B cell differentiation. Expression of the gene encoding miR-155, known as MIR155HG, is controled by several transcription factors, among them MYB, a member of an oncogenic E-box protein family. Levels of MYB itself are controled by microRNA miR-150. In this study, we measured levels of miR-155, PU.1, MYB and miR-150 in lymph nodes of patients with chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma (B-CLL/SLL, N=20), diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL, N=24), follicular lymphoma (FL, N=29), Hodgkin lymphoma (HL, N=25), marginal zone lymphoma (MZL, N=13), and mantle cell lymphoma (MCL, N=10). We also measured levels of these molecules in lymph nodes with the finding of strong inflammation (N=4). We found that patients of all the diagnoses except of MCL display heterogeneously elevated levels of miR-155 and correspondingly...