dc.contributor.advisor | Brábek, Jan | |
dc.creator | Turchyna, Kateryna | |
dc.date.accessioned | 2025-02-19T10:53:39Z | |
dc.date.available | 2025-02-19T10:53:39Z | |
dc.date.issued | 2025 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/196910 | |
dc.description.abstract | Membránová matrixová metaloproteáza typu 1 (MT1-MMP) je enzym, který se zásadně podílí na invazivitě nádorových buněk. V této práci jsme se zaměřili na zkoumání interakčních partnerů MT1-MMP, abychom rozšířili naše porozumění buněčným procesům, kterých se tento enzym aktivně účastní. Abychom mohli MT1-MMP purifikovat a následně analyzovat její interaktory hmotnostní spektrometrií, fúzovali jsme WT a mutantní varianty tohoto enzymu se Strep/FLAG značkou. Naše předběžné výsledky naznačují, že v lidských buňkách MT1-MMP zřejmě interaguje s proteinem desmoglein-2. Tuto potenciální interakci jsme se zde snažili ověřit pomocí imunoprecipitačních experimentů. | cs_CZ |
dc.description.abstract | Membrane Type 1 Matrix Metalloproteinase (MT1-MMP) is an enzyme with critical role in cancer cells invasiveness. In this work we aimed to investigate interaction partners of MT1-MMP to broaden our understanding of the processes the enzyme takes an active part in. We have modified sequences of the metalloproteinase and its mutant variants with Strep/FLAG-tags insertion to allow for affinity purification and subsequent analysis of isolated potential interactors via mass spectrometry. Our preliminary data suggest that desmoglein-2 (DSG2) potentially binds MT1-MMP in human cells. Here we tried to verify the supposed interaction using coimunoprecipitation assays. | en_US |
dc.language | English | cs_CZ |
dc.language.iso | en_US | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | Invazivita nádorových buněk | cs_CZ |
dc.subject | metaloproteázy | cs_CZ |
dc.subject | MT1-MMP | cs_CZ |
dc.subject | interakční partneři | cs_CZ |
dc.subject | desmoglein-2 | cs_CZ |
dc.subject | koimunoprecipitace | cs_CZ |
dc.subject | Cancer invasiveness | en_US |
dc.subject | metalloproteinases | en_US |
dc.subject | MT1-MMP | en_US |
dc.subject | interaction partners | en_US |
dc.subject | desmoglein-2 | en_US |
dc.subject | coimmunoprecipitation | en_US |
dc.title | The identification of novel MT1-MMP interaction partners | en_US |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2025 | |
dcterms.dateAccepted | 2025-01-27 | |
dc.description.department | Department of Cell Biology | en_US |
dc.description.department | Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.identifier.repId | 252666 | |
dc.title.translated | Identifikace nových interakčních partnerů proteinu MT1-MMP | cs_CZ |
dc.contributor.referee | Janoštiak, Radoslav | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Cell Biology | en_US |
thesis.degree.discipline | Buněčná biologie | cs_CZ |
thesis.degree.program | Cell Biology | en_US |
thesis.degree.program | Buněčná biologie | cs_CZ |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Cell Biology | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Buněčná biologie | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Cell Biology | en_US |
uk.degree-program.cs | Buněčná biologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Cell Biology | en_US |
thesis.grade.cs | Velmi dobře | cs_CZ |
thesis.grade.en | Very good | en_US |
uk.abstract.cs | Membránová matrixová metaloproteáza typu 1 (MT1-MMP) je enzym, který se zásadně podílí na invazivitě nádorových buněk. V této práci jsme se zaměřili na zkoumání interakčních partnerů MT1-MMP, abychom rozšířili naše porozumění buněčným procesům, kterých se tento enzym aktivně účastní. Abychom mohli MT1-MMP purifikovat a následně analyzovat její interaktory hmotnostní spektrometrií, fúzovali jsme WT a mutantní varianty tohoto enzymu se Strep/FLAG značkou. Naše předběžné výsledky naznačují, že v lidských buňkách MT1-MMP zřejmě interaguje s proteinem desmoglein-2. Tuto potenciální interakci jsme se zde snažili ověřit pomocí imunoprecipitačních experimentů. | cs_CZ |
uk.abstract.en | Membrane Type 1 Matrix Metalloproteinase (MT1-MMP) is an enzyme with critical role in cancer cells invasiveness. In this work we aimed to investigate interaction partners of MT1-MMP to broaden our understanding of the processes the enzyme takes an active part in. We have modified sequences of the metalloproteinase and its mutant variants with Strep/FLAG-tags insertion to allow for affinity purification and subsequent analysis of isolated potential interactors via mass spectrometry. Our preliminary data suggest that desmoglein-2 (DSG2) potentially binds MT1-MMP in human cells. Here we tried to verify the supposed interaction using coimunoprecipitation assays. | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
thesis.grade.code | 2 | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |
uk.thesis.defenceStatus | O | |